22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1283 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  97.28 
 
 		 810 aa  1637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 		 810 aa  1690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.86 
 
 		 753 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.22 
 
 		 757 aa  492  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  37.48 
 
 		 777 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.67 
 
 		 772 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  36.62 
 
 		 773 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  36.01 
 
 		 753 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.95 
 
 		 757 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.54 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  35.14 
 
 		 717 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.84 
 
 		 765 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  29.6 
 
 		 705 aa  300  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  29.56 
 
 		 691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  30.69 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  25.06 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  24.21 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  24.51 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.36 
 
 		 556 aa  54.7  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  26.39 
 
 		 1389 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 1728 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1589 aa  44.3  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>