36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2950 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1084    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  28.19 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  27.56 
 
 
503 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  32.22 
 
 
614 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.67 
 
 
772 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  30.36 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  33.68 
 
 
670 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  24.59 
 
 
773 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.51 
 
 
757 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.13 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  27.93 
 
 
691 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.72 
 
 
757 aa  73.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  30.63 
 
 
765 aa  73.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.45 
 
 
753 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  23.53 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  25.19 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  26.98 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  30.36 
 
 
705 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.12 
 
 
765 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  28.21 
 
 
717 aa  67.8  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  26.02 
 
 
514 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  23.83 
 
 
569 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  26.48 
 
 
542 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.45 
 
 
515 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  24.48 
 
 
559 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.79 
 
 
810 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.86 
 
 
584 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  26.85 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.79 
 
 
810 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.54 
 
 
547 aa  57.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  28.33 
 
 
753 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  25.91 
 
 
565 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  24.8 
 
 
528 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  26.03 
 
 
522 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  23.6 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  24.32 
 
 
1282 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>