59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2496 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  49.61 
 
 
1051 aa  698    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  53.12 
 
 
1728 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  40.85 
 
 
1752 aa  979    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  43.44 
 
 
2135 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  52.66 
 
 
2337 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  40.93 
 
 
1781 aa  982    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  41.48 
 
 
1627 aa  1022    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  48.84 
 
 
1785 aa  1295    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  100 
 
 
1589 aa  3171    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.85 
 
 
1282 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  42.47 
 
 
1744 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  35.15 
 
 
1389 aa  589  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  36.35 
 
 
824 aa  362  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.33 
 
 
1838 aa  313  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  38.29 
 
 
1005 aa  282  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  44.55 
 
 
1009 aa  262  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  34.64 
 
 
556 aa  222  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 
509 aa  218  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29.74 
 
 
565 aa  158  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  31.5 
 
 
552 aa  154  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.24 
 
 
522 aa  152  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  29.02 
 
 
528 aa  151  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.3 
 
 
542 aa  149  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  43.1 
 
 
631 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  30.58 
 
 
553 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  28.4 
 
 
514 aa  133  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  28.75 
 
 
569 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  27.29 
 
 
506 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  35.43 
 
 
458 aa  118  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  40.97 
 
 
523 aa  112  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  44.81 
 
 
430 aa  111  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  44.53 
 
 
642 aa  111  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  28.02 
 
 
584 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.23 
 
 
1066 aa  108  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  27.5 
 
 
614 aa  97.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  26.1 
 
 
628 aa  94  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  42.71 
 
 
119 aa  88.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  27.31 
 
 
448 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.21 
 
 
503 aa  77.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.03 
 
 
559 aa  73.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.89 
 
 
515 aa  72  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.24 
 
 
547 aa  66.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  26.82 
 
 
546 aa  63.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  35.04 
 
 
2117 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  23.31 
 
 
670 aa  58.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.46 
 
 
4022 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  28.21 
 
 
4009 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.27 
 
 
765 aa  55.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  32.14 
 
 
486 aa  53.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  38.03 
 
 
717 aa  53.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.33 
 
 
1686 aa  53.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.33 
 
 
757 aa  52  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  40.2 
 
 
595 aa  50.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.52 
 
 
1590 aa  50.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.24 
 
 
1627 aa  50.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  39.51 
 
 
426 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.17 
 
 
1762 aa  47.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.2 
 
 
772 aa  47.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.66 
 
 
773 aa  46.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>