35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7060 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 		 757 aa  1529    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  44.75 
 
 		 772 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  43.36 
 
 		 777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  44.61 
 
 		 773 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  43.03 
 
 		 753 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.22 
 
 		 810 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  39.31 
 
 		 753 aa  472  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.32 
 
 		 810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  36.13 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.95 
 
 		 757 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  42.38 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  37.67 
 
 		 717 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  35.62 
 
 		 705 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  33.07 
 
 		 691 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  32.84 
 
 		 670 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  26.01 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  29.51 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.28 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  27.15 
 
 		 614 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  25.16 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  23.51 
 
 		 503 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  24.7 
 
 		 522 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  25.53 
 
 		 1389 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  24.04 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  22.69 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  25.78 
 
 		 2337 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 1728 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 		 2135 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  23.13 
 
 		 514 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  20.85 
 
 		 542 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  21.21 
 
 		 1005 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.78 
 
 		 515 aa  45.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1051 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  22.48 
 
 		 546 aa  45.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>