44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1672 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1450    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.38 
 
 		 772 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  36.07 
 
 		 777 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  36.26 
 
 		 773 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.27 
 
 		 753 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.67 
 
 		 757 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.01 
 
 		 810 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.63 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  39.18 
 
 		 753 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.24 
 
 		 757 aa  363  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.94 
 
 		 765 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  36.55 
 
 		 705 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  34.12 
 
 		 691 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.86 
 
 		 765 aa  337  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  37.42 
 
 		 670 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  25.21 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  24.89 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  28.21 
 
 		 541 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  24.47 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  24.26 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.55 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  24.65 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  25.79 
 
 		 1005 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.24 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.72 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  23.99 
 
 		 614 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1781 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  20.91 
 
 		 542 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  25.57 
 
 		 522 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  23.26 
 
 		 509 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1752 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  22.55 
 
 		 2135 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1589 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  25.2 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  21.79 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1051 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  37.14 
 
 		 628 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  32.88 
 
 		 569 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1838 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  33.82 
 
 		 2337 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  27.85 
 
 		 1389 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  22.74 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  26.61 
 
 		 552 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  33.82 
 
 		 1728 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>