19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1500 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 		 810 aa  1691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  97.28 
 
 		 810 aa  1637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  39.11 
 
 		 753 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.32 
 
 		 757 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  37.11 
 
 		 777 aa  482  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.42 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  36.25 
 
 		 773 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.82 
 
 		 757 aa  429  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  36.29 
 
 		 753 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.33 
 
 		 765 aa  412  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  34.75 
 
 		 717 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.84 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  29.4 
 
 		 705 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  34.53 
 
 		 691 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  29.83 
 
 		 670 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  25.51 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.13 
 
 		 556 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  23.36 
 
 		 506 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>