32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0158 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  64.74 
 
 
772 aa  1074    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  100 
 
 
777 aa  1614    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  68.34 
 
 
773 aa  1145    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  47.12 
 
 
753 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  43.36 
 
 
757 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.48 
 
 
810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.11 
 
 
810 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.52 
 
 
753 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.93 
 
 
765 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.52 
 
 
757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  36.07 
 
 
717 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.25 
 
 
765 aa  346  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  29.5 
 
 
705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  30.57 
 
 
691 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  31.33 
 
 
670 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  24.94 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.09 
 
 
556 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  20.45 
 
 
506 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23 
 
 
515 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  24.67 
 
 
1389 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  23.81 
 
 
503 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  22.26 
 
 
514 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  22.92 
 
 
614 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.24 
 
 
448 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  23.46 
 
 
559 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  22.6 
 
 
522 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  20.63 
 
 
542 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  21.82 
 
 
546 aa  51.2  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.84 
 
 
1781 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  27.27 
 
 
1752 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  21.67 
 
 
1005 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  23.53 
 
 
547 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>