26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0711 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1397    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  47.31 
 
 		 705 aa  561  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  34.12 
 
 		 717 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.33 
 
 		 765 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.6 
 
 		 753 aa  317  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.92 
 
 		 757 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.07 
 
 		 757 aa  303  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.2 
 
 		 772 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  30.86 
 
 		 773 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  30.57 
 
 		 777 aa  280  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  33.86 
 
 		 753 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.56 
 
 		 810 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  30.92 
 
 		 670 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  30.73 
 
 		 765 aa  259  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.53 
 
 		 810 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  27.93 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  28.14 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.61 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  23.56 
 
 		 506 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.57 
 
 		 546 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  40.62 
 
 		 547 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  22.69 
 
 		 559 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  24.24 
 
 		 569 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  39.68 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  26.62 
 
 		 1005 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.15 
 
 		 515 aa  44.3  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>