39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4474 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1157    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  76.54 
 
 
458 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  47.77 
 
 
584 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  37.88 
 
 
565 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  37.42 
 
 
552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  34.2 
 
 
528 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  34.98 
 
 
556 aa  236  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  35.01 
 
 
553 aa  234  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.73 
 
 
509 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  31.01 
 
 
1005 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  30.31 
 
 
1785 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.12 
 
 
522 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.77 
 
 
542 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  29.42 
 
 
1051 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  30.05 
 
 
1838 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  28.93 
 
 
1781 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.81 
 
 
1752 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  28.75 
 
 
1589 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.52 
 
 
514 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  27.97 
 
 
1728 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.54 
 
 
2337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  28.61 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.53 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  30.55 
 
 
1282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  27.36 
 
 
1627 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.24 
 
 
1744 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  25.54 
 
 
2135 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  26.33 
 
 
1389 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.47 
 
 
503 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.98 
 
 
448 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  24.09 
 
 
541 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  26.85 
 
 
628 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  25.76 
 
 
559 aa  62.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.09 
 
 
546 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  21.01 
 
 
515 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  23.85 
 
 
547 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.77 
 
 
670 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  32.88 
 
 
717 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  24.24 
 
 
691 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>