22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0708 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1392    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  47.31 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  36.55 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.62 
 
 		 757 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.11 
 
 		 772 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  33.38 
 
 		 765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  32.57 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.47 
 
 		 810 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.99 
 
 		 753 aa  289  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  34.27 
 
 		 753 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  29.27 
 
 		 810 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  29.5 
 
 		 777 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  40.5 
 
 		 765 aa  283  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  29.4 
 
 		 773 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  34.06 
 
 		 670 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.32 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  30.36 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  25.84 
 
 		 614 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  24.14 
 
 		 522 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  22.82 
 
 		 506 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  25.16 
 
 		 546 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  27.07 
 
 		 503 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>