46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4361 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  49.61 
 
 		 772 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  47.12 
 
 		 777 aa  736    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  100 
 
 		 753 aa  1512    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  48.09 
 
 		 773 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  43.03 
 
 		 757 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.01 
 
 		 810 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.29 
 
 		 810 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  37.37 
 
 		 753 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  39.18 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  35.14 
 
 		 765 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.26 
 
 		 765 aa  362  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.51 
 
 		 757 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  34.53 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  34.25 
 
 		 691 aa  300  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  36.78 
 
 		 670 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.01 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  29.95 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  24.24 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  25.24 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.82 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  24.3 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  23.78 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  28.19 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  25.32 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  23.93 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  25.58 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  24.19 
 
 		 1005 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  26.67 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  27.31 
 
 		 1389 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  23.52 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  28.52 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.66 
 
 		 565 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  22.27 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  23.71 
 
 		 514 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  24.26 
 
 		 2135 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  26.58 
 
 		 547 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1589 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  25.06 
 
 		 553 aa  50.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  25.4 
 
 		 1728 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  23.33 
 
 		 542 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1752 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  32.73 
 
 		 2337 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1282 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1781 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 559 aa  44.3  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>