40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5667 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  1185    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  47.77 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  48.93 
 
 
458 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  33.97 
 
 
528 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  36.36 
 
 
565 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  33.82 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  34.92 
 
 
552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.95 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  29.57 
 
 
509 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.53 
 
 
522 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  29.56 
 
 
1005 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  27.79 
 
 
2337 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  29.29 
 
 
514 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  27.49 
 
 
542 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28 
 
 
506 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  27.27 
 
 
1785 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  27.18 
 
 
1728 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  27.67 
 
 
1051 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  25.77 
 
 
1838 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  26.93 
 
 
1627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.43 
 
 
1781 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  28.02 
 
 
1589 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  25.68 
 
 
1752 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  29.71 
 
 
614 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 
2135 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.01 
 
 
503 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  28.42 
 
 
1282 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  25.7 
 
 
1744 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  25.09 
 
 
1389 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  23.93 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  25.56 
 
 
515 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  29.88 
 
 
546 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  23.77 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.86 
 
 
541 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  24.01 
 
 
547 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  24.36 
 
 
628 aa  51.2  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  21.79 
 
 
717 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  37.84 
 
 
670 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  21.99 
 
 
773 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  25.58 
 
 
753 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>