46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7053 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1049    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  44.12 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  48.15 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  44.6 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  39.33 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  30.07 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  31.77 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  26.71 
 
 		 1005 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1785 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  32.93 
 
 		 565 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  28.23 
 
 		 2135 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  29.29 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1051 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  27.13 
 
 		 1728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1781 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.62 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1838 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  27.4 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 		 2337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  27.52 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  26.37 
 
 		 1389 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  29.37 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1627 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  27.76 
 
 		 553 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  26.89 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  27.6 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1744 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1282 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.62 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  25.17 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.95 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.65 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  32.02 
 
 		 191 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  26.02 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  25.21 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.57 
 
 		 765 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.02 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.47 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.93 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  24.46 
 
 		 765 aa  60.1  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  24.86 
 
 		 628 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  22.26 
 
 		 777 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.13 
 
 		 757 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.77 
 
 		 753 aa  43.9  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>