47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0342 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1069    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  44.12 
 
 
514 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  42.44 
 
 
542 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  39.83 
 
 
506 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  36.13 
 
 
556 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  30.45 
 
 
1005 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  29.69 
 
 
509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.98 
 
 
1781 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  32.43 
 
 
1752 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  31.01 
 
 
1838 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  32.26 
 
 
528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  29.53 
 
 
584 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  30.51 
 
 
565 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  31.25 
 
 
1389 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  29.42 
 
 
1728 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  28.79 
 
 
1785 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  29.35 
 
 
1051 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  29.47 
 
 
1627 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  29.24 
 
 
1589 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.74 
 
 
2337 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  29.12 
 
 
569 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  31.35 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  28.81 
 
 
1744 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  27.57 
 
 
553 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  30.05 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.3 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  28.43 
 
 
2135 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.6 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  26.49 
 
 
1282 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  27.56 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.21 
 
 
559 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  25.06 
 
 
515 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.94 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  27.22 
 
 
628 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.94 
 
 
546 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.54 
 
 
670 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.37 
 
 
765 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.67 
 
 
772 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.7 
 
 
757 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.03 
 
 
541 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  25.57 
 
 
717 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  24 
 
 
773 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  22.6 
 
 
777 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  24.14 
 
 
705 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  23.54 
 
 
765 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.9 
 
 
753 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>