166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3051 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  45.84 
 
 
1838 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  40.03 
 
 
1627 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  40.94 
 
 
1282 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  100 
 
 
1744 aa  3426    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  50.06 
 
 
1051 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  42.69 
 
 
1589 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  47.41 
 
 
1785 aa  885    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  51.12 
 
 
1752 aa  1054    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  55.47 
 
 
1728 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  38.33 
 
 
1389 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  51.78 
 
 
2337 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  42.71 
 
 
2135 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  46.34 
 
 
1781 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  36.63 
 
 
1005 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.05 
 
 
1066 aa  262  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  37.9 
 
 
1009 aa  250  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  37.53 
 
 
824 aa  214  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.52 
 
 
556 aa  190  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  46.44 
 
 
631 aa  177  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.75 
 
 
4978 aa  160  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  29.54 
 
 
509 aa  160  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.57 
 
 
522 aa  145  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  30.7 
 
 
553 aa  140  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  27.76 
 
 
528 aa  135  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  28.02 
 
 
565 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  48.67 
 
 
523 aa  135  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.75 
 
 
5745 aa  126  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.31 
 
 
552 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  44.89 
 
 
721 aa  124  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.42 
 
 
2767 aa  124  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.46 
 
 
542 aa  122  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  43.35 
 
 
1597 aa  121  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  39.68 
 
 
663 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 
16322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  41.89 
 
 
642 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  27.09 
 
 
569 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  43.59 
 
 
430 aa  112  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  29.18 
 
 
506 aa  109  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.42 
 
 
1884 aa  108  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  26.82 
 
 
1006 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  26.24 
 
 
458 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.44 
 
 
2816 aa  106  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.32 
 
 
584 aa  102  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.07 
 
 
1712 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  26.58 
 
 
514 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.59 
 
 
3191 aa  99.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  30.54 
 
 
614 aa  99.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  25.52 
 
 
2353 aa  97.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.59 
 
 
1367 aa  91.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.16 
 
 
4848 aa  90.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  27.03 
 
 
1363 aa  89.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  31.32 
 
 
1512 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.21 
 
 
3474 aa  86.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.34 
 
 
994 aa  86.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.09 
 
 
1268 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.48 
 
 
3816 aa  82.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  36.08 
 
 
2377 aa  82  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  45.88 
 
 
119 aa  81.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.68 
 
 
1416 aa  80.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.38 
 
 
761 aa  79.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.56 
 
 
9867 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  36.32 
 
 
1269 aa  78.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  38.31 
 
 
814 aa  78.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.4 
 
 
559 aa  77.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.14 
 
 
2522 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.05 
 
 
2507 aa  77.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.18 
 
 
3477 aa  77  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 
982 aa  77.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.28 
 
 
3363 aa  77  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.81 
 
 
2807 aa  76.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  27.73 
 
 
6211 aa  76.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.33 
 
 
3089 aa  76.3  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  34.13 
 
 
1911 aa  75.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.8 
 
 
2839 aa  74.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  28.57 
 
 
503 aa  74.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.6 
 
 
1867 aa  73.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.33 
 
 
3544 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.71 
 
 
2114 aa  73.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.9 
 
 
2476 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  45.68 
 
 
5444 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.52 
 
 
3927 aa  72  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.76 
 
 
1502 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.4 
 
 
850 aa  70.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.87 
 
 
4122 aa  70.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  35.23 
 
 
1269 aa  69.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 
3699 aa  70.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.17 
 
 
2503 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  32.84 
 
 
892 aa  68.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  36.03 
 
 
5769 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 
3396 aa  67.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  33.67 
 
 
755 aa  67  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  36.22 
 
 
1538 aa  67  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  33.82 
 
 
743 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  31.55 
 
 
722 aa  66.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.77 
 
 
3699 aa  66.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  29.47 
 
 
1287 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  25.7 
 
 
2027 aa  63.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 
1215 aa  64.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.7 
 
 
2153 aa  64.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 
1215 aa  64.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>