12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0779 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  37.99 
 
 
542 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  31.89 
 
 
506 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  31.82 
 
 
522 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  30.37 
 
 
556 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  32.02 
 
 
514 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29 
 
 
565 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  30.2 
 
 
528 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  27.78 
 
 
509 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  25.41 
 
 
1005 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  26.37 
 
 
553 aa  42.4  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.9 
 
 
552 aa  41.6  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>