48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0701 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1047    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  38.41 
 
 
556 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  35.12 
 
 
1005 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  33.61 
 
 
1589 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  34.95 
 
 
1785 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  33.27 
 
 
1838 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  32.46 
 
 
1051 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  30.31 
 
 
522 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  30.78 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  31.05 
 
 
2135 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  33.41 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.69 
 
 
1781 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  32.45 
 
 
506 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  31.5 
 
 
1752 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  32.19 
 
 
1728 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  30.43 
 
 
528 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  31.51 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  32.06 
 
 
1627 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  30.28 
 
 
553 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  29.36 
 
 
584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  30.52 
 
 
2337 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  30.51 
 
 
514 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  31.55 
 
 
458 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.28 
 
 
552 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  30.02 
 
 
1744 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  28.54 
 
 
1389 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  27.49 
 
 
1282 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.84 
 
 
614 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.5 
 
 
448 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.55 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  22.43 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  24.18 
 
 
628 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  23.71 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  22.32 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  20 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.34 
 
 
670 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  23.26 
 
 
717 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  24.03 
 
 
753 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.48 
 
 
757 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.69 
 
 
765 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  20.81 
 
 
765 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  21.29 
 
 
772 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  28.02 
 
 
191 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  20.4 
 
 
777 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  23.6 
 
 
541 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.05 
 
 
773 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.63 
 
 
757 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.87 
 
 
753 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>