51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2682 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1148    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  39.33 
 
 
514 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  40.36 
 
 
542 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  37.72 
 
 
1005 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  36.13 
 
 
522 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  38.41 
 
 
509 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  39 
 
 
506 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  37.19 
 
 
565 aa  256  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  36.11 
 
 
528 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  35.78 
 
 
1785 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  34.45 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  34.95 
 
 
1838 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  34.98 
 
 
569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  32.95 
 
 
584 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  36.17 
 
 
1589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  33.51 
 
 
1728 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  34.6 
 
 
2337 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  32.58 
 
 
1051 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  33.64 
 
 
458 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  35.21 
 
 
1752 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  34.92 
 
 
1781 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  33.48 
 
 
552 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  33.6 
 
 
2135 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  31.59 
 
 
1389 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  29.15 
 
 
1627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  31.83 
 
 
1744 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  29.98 
 
 
1282 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.2 
 
 
614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  30.03 
 
 
448 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.48 
 
 
503 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  28.3 
 
 
628 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.97 
 
 
515 aa  97.8  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  23.47 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  23.68 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  22.91 
 
 
546 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  30.37 
 
 
191 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.72 
 
 
753 aa  70.5  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  24 
 
 
765 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.64 
 
 
765 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.28 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  23.09 
 
 
777 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  23.94 
 
 
670 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.04 
 
 
773 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  24.65 
 
 
717 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  27.04 
 
 
753 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.85 
 
 
541 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  23.61 
 
 
691 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.77 
 
 
772 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25 
 
 
810 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.12 
 
 
810 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  22.66 
 
 
757 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>