36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1673 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 
753 aa  1551    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  41.7 
 
 
757 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.86 
 
 
810 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  39.27 
 
 
810 aa  492  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  39.31 
 
 
757 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.73 
 
 
772 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  38.73 
 
 
765 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  35.52 
 
 
777 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  36.38 
 
 
773 aa  442  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  37.37 
 
 
753 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  37.27 
 
 
717 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.56 
 
 
765 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  33.73 
 
 
691 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  32.25 
 
 
705 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  31.71 
 
 
670 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  29.45 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  23.72 
 
 
556 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.78 
 
 
559 aa  62.4  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  24.13 
 
 
448 aa  58.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  25.6 
 
 
1005 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  22.99 
 
 
614 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  23.67 
 
 
1389 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.17 
 
 
503 aa  51.2  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.23 
 
 
546 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
2135 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  35.71 
 
 
628 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  24.07 
 
 
506 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  21.74 
 
 
1051 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  23.78 
 
 
1744 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  32.5 
 
 
547 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  28.57 
 
 
528 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  23.59 
 
 
1627 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  21.94 
 
 
515 aa  45.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  25.9 
 
 
522 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  23.77 
 
 
514 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  26.92 
 
 
1282 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>