38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2052 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  100 
 
 		 772 aa  1596    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  64.74 
 
 		 777 aa  1074    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  65.59 
 
 		 773 aa  1077    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  49.67 
 
 		 753 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  44.75 
 
 		 757 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.67 
 
 		 810 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.42 
 
 		 810 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.6 
 
 		 753 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  35.19 
 
 		 765 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  37.38 
 
 		 717 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.76 
 
 		 757 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.78 
 
 		 765 aa  343  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  31.11 
 
 		 705 aa  314  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  31.2 
 
 		 691 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  32.99 
 
 		 670 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.67 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.86 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  23.93 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  27.94 
 
 		 1389 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.77 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  26.67 
 
 		 522 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  23.27 
 
 		 542 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  36.84 
 
 		 448 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  24.77 
 
 		 556 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  25.79 
 
 		 2135 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  31.82 
 
 		 628 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.08 
 
 		 515 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  26.79 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  23.08 
 
 		 1005 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  24.57 
 
 		 547 aa  51.6  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  21.29 
 
 		 509 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.06 
 
 		 4761 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.42 
 
 		 559 aa  49.3  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1781 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1589 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1752 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1627 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>