76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1933 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  47.33 
 
 
1744 aa  899    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  37.69 
 
 
1389 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  44.2 
 
 
1752 aa  1164    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  100 
 
 
1785 aa  3536    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  51.53 
 
 
1838 aa  858    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  48.9 
 
 
1589 aa  1312    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  41.84 
 
 
1282 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  54.46 
 
 
1728 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  54.31 
 
 
2337 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  46.25 
 
 
2135 aa  733    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  54.11 
 
 
1051 aa  794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  45.6 
 
 
1627 aa  1277    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  44.8 
 
 
1781 aa  1174    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  44.65 
 
 
824 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  47.94 
 
 
1009 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  50.15 
 
 
631 aa  317  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  41.15 
 
 
1005 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  35.59 
 
 
556 aa  251  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  34.01 
 
 
509 aa  215  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  31.84 
 
 
565 aa  170  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  28.93 
 
 
528 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  32.29 
 
 
552 aa  161  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  31.56 
 
 
553 aa  160  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  28.11 
 
 
522 aa  157  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  30.41 
 
 
569 aa  148  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  29.25 
 
 
514 aa  145  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.71 
 
 
542 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.81 
 
 
458 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  27.22 
 
 
584 aa  133  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  45.52 
 
 
523 aa  129  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.14 
 
 
1066 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.67 
 
 
506 aa  124  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  42.33 
 
 
642 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  32.41 
 
 
614 aa  110  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  40.74 
 
 
430 aa  105  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  46.39 
 
 
119 aa  102  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.5 
 
 
503 aa  95.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.57 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  28.52 
 
 
559 aa  81.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  28.47 
 
 
628 aa  79  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.88 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  25.71 
 
 
515 aa  71.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  26.51 
 
 
546 aa  66.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  22.53 
 
 
670 aa  62.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  41.05 
 
 
2117 aa  61.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40.82 
 
 
1590 aa  58.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 
426 aa  57.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  34.15 
 
 
368 aa  55.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  38.53 
 
 
4761 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.67 
 
 
1686 aa  53.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40 
 
 
400 aa  52.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  36.19 
 
 
595 aa  52.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.61 
 
 
2002 aa  52.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  36.89 
 
 
2002 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.03 
 
 
434 aa  50.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  27.19 
 
 
539 aa  50.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  35.29 
 
 
491 aa  50.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.08 
 
 
1627 aa  50.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  39 
 
 
2178 aa  50.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  38.74 
 
 
3925 aa  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.58 
 
 
765 aa  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  36.27 
 
 
651 aa  49.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.46 
 
 
1152 aa  48.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 
412 aa  48.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.14 
 
 
501 aa  48.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 
1129 aa  48.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  36.89 
 
 
1123 aa  47.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.68 
 
 
414 aa  47.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  38.68 
 
 
665 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  40 
 
 
656 aa  47  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  39.18 
 
 
1026 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 
1762 aa  46.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.11 
 
 
1669 aa  46.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  32.56 
 
 
3586 aa  46.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  35.11 
 
 
352 aa  46.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  24.39 
 
 
765 aa  45.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>