45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0333 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1114    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  46.11 
 
 
506 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  42.44 
 
 
522 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  44.6 
 
 
514 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  40 
 
 
556 aa  296  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.29 
 
 
1005 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  32.89 
 
 
509 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  32.73 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  29.3 
 
 
1589 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  30.32 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  28.48 
 
 
1752 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  27.61 
 
 
1781 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  29.77 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  27.26 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  29.71 
 
 
1785 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  28.51 
 
 
1051 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  29.29 
 
 
458 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  29.35 
 
 
1728 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  27.6 
 
 
553 aa  134  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  29.69 
 
 
2337 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.85 
 
 
1838 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  28.31 
 
 
1389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  27.8 
 
 
1627 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  30.08 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  27.63 
 
 
2135 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  29.3 
 
 
552 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  30.39 
 
 
1282 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  30.67 
 
 
1744 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  24.64 
 
 
448 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.34 
 
 
503 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  37.99 
 
 
191 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  22.45 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.66 
 
 
765 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.48 
 
 
546 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.48 
 
 
541 aa  63.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  23.01 
 
 
547 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  23.58 
 
 
628 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  22.78 
 
 
559 aa  60.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.27 
 
 
772 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  20.91 
 
 
717 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  22.5 
 
 
773 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  20.55 
 
 
777 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  25.62 
 
 
670 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  22.17 
 
 
765 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  20.85 
 
 
757 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>