180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6412 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  51.97 
 
 		 1838 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2337 aa  4601    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  53.23 
 
 		 1744 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  51.86 
 
 		 1781 aa  843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  52.78 
 
 		 1589 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  52.9 
 
 		 1051 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  54.11 
 
 		 1785 aa  755    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  51.87 
 
 		 1752 aa  844    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  47.81 
 
 		 1389 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  47.28 
 
 		 2135 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  82.94 
 
 		 1728 aa  2766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1282 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  30.93 
 
 		 3508 aa  280  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  35.64 
 
 		 1005 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.79 
 
 		 556 aa  226  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  41.41 
 
 		 3598 aa  225  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  43.06 
 
 		 4231 aa  189  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.25 
 
 		 509 aa  174  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.91 
 
 		 11716 aa  175  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  57.23 
 
 		 1009 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  42.15 
 
 		 2001 aa  171  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  35.71 
 
 		 3714 aa  164  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  43.55 
 
 		 631 aa  164  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  28.82 
 
 		 522 aa  153  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  37.57 
 
 		 2853 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  38.12 
 
 		 4465 aa  149  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  48 
 
 		 1627 aa  149  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  33.39 
 
 		 5020 aa  147  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  34.53 
 
 		 2820 aa  143  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  27.79 
 
 		 584 aa  142  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29.46 
 
 		 565 aa  142  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  37.86 
 
 		 3026 aa  140  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  27.8 
 
 		 528 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.9 
 
 		 542 aa  133  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  48.92 
 
 		 642 aa  130  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.97 
 
 		 552 aa  128  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  42.94 
 
 		 430 aa  128  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  27.59 
 
 		 506 aa  128  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.59 
 
 		 514 aa  128  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.45 
 
 		 553 aa  127  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.36 
 
 		 4854 aa  126  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  42.99 
 
 		 824 aa  125  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  45.14 
 
 		 523 aa  120  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  28.24 
 
 		 569 aa  119  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.14 
 
 		 2522 aa  117  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.62 
 
 		 3544 aa  116  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1066 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.51 
 
 		 16311 aa  113  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 3699 aa  112  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 3699 aa  109  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  52.1 
 
 		 2954 aa  108  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  36.16 
 
 		 2887 aa  106  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.73 
 
 		 458 aa  105  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.11 
 
 		 5769 aa  103  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.01 
 
 		 2784 aa  102  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.67 
 
 		 1055 aa  102  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  40.48 
 
 		 2132 aa  99  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  44.79 
 
 		 5094 aa  99  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  48.45 
 
 		 119 aa  96.3  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  30.43 
 
 		 3439 aa  94.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.58 
 
 		 614 aa  92  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  51.4 
 
 		 1610 aa  86.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  44.19 
 
 		 3209 aa  85.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  29.44 
 
 		 2127 aa  85.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.17 
 
 		 1599 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.87 
 
 		 5098 aa  84.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.57 
 
 		 559 aa  84  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 2701 aa  84.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.11 
 
 		 1553 aa  84  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  32.82 
 
 		 4285 aa  82.8  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.77 
 
 		 2678 aa  82.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  42.14 
 
 		 2060 aa  80.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.92 
 
 		 1019 aa  79.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.04 
 
 		 3182 aa  79.7  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.1 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.24 
 
 		 515 aa  77.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.06 
 
 		 2067 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 2555 aa  77  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3391 aa  75.9  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.57 
 
 		 448 aa  75.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  50 
 
 		 1610 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  37.5 
 
 		 1342 aa  74.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  29.39 
 
 		 3091 aa  73.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.19 
 
 		 3474 aa  74.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.43 
 
 		 3259 aa  73.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.43 
 
 		 503 aa  73.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.19 
 
 		 3038 aa  71.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.18 
 
 		 1597 aa  69.7  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  26.5 
 
 		 2461 aa  68.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  27.02 
 
 		 3758 aa  67.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.9 
 
 		 7149 aa  67.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.1 
 
 		 2816 aa  67.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.11 
 
 		 5745 aa  66.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  42.59 
 
 		 1586 aa  64.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.96 
 
 		 5442 aa  64.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.51 
 
 		 765 aa  64.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.48 
 
 		 2812 aa  64.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  24.11 
 
 		 2743 aa  64.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  27.46 
 
 		 3542 aa  64.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.91 
 
 		 3396 aa  64.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>