More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0369 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  45.43 
 
 		 3229 aa  1130    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  39.09 
 
 		 3259 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  42.44 
 
 		 4661 aa  803    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  43.77 
 
 		 4285 aa  800    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.97 
 
 		 1553 aa  955    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2067 aa  4007    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.36 
 
 		 16311 aa  566  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  33.88 
 
 		 3182 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.25 
 
 		 1599 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.13 
 
 		 1883 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.17 
 
 		 6678 aa  357  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.49 
 
 		 8871 aa  339  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.33 
 
 		 4854 aa  327  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  31.83 
 
 		 2567 aa  323  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.92 
 
 		 5020 aa  293  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  29.95 
 
 		 2784 aa  255  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 		 2812 aa  246  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.29 
 
 		 2743 aa  234  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  30.21 
 
 		 5094 aa  227  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  28.12 
 
 		 1206 aa  207  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  30.36 
 
 		 2127 aa  206  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.64 
 
 		 3714 aa  204  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  25.6 
 
 		 3508 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  24.81 
 
 		 3439 aa  195  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.85 
 
 		 2239 aa  185  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  26.57 
 
 		 3758 aa  169  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  32.36 
 
 		 2461 aa  166  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.77 
 
 		 1963 aa  153  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.83 
 
 		 14916 aa  151  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  25.58 
 
 		 3091 aa  142  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  24.78 
 
 		 2887 aa  136  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 3699 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  25.83 
 
 		 3132 aa  130  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.63 
 
 		 4836 aa  127  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.76 
 
 		 8321 aa  127  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.27 
 
 		 3699 aa  127  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.73 
 
 		 5839 aa  126  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  44.94 
 
 		 4214 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.13 
 
 		 5442 aa  107  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 		 2524 aa  107  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.78 
 
 		 5787 aa  107  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 1141 aa  106  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.09 
 
 		 4220 aa  105  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  35.71 
 
 		 2768 aa  103  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 2812 aa  102  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.19 
 
 		 5098 aa  99  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.38 
 
 		 2555 aa  95.9  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  37.93 
 
 		 6779 aa  95.9  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 6662 aa  95.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 6683 aa  94.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 		 3038 aa  92  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  36.97 
 
 		 4791 aa  90.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  45.7 
 
 		 16322 aa  89.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 		 1166 aa  88.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.56 
 
 		 5171 aa  88.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  35.91 
 
 		 8682 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  35.91 
 
 		 9030 aa  87  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  35.59 
 
 		 6753 aa  86.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  34.93 
 
 		 2336 aa  85.9  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1699 aa  84.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  38.93 
 
 		 2452 aa  83.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  38.14 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  32.7 
 
 		 3026 aa  82.8  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  50.55 
 
 		 1424 aa  82.4  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  41.04 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.26 
 
 		 5962 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  41.25 
 
 		 219 aa  80.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.39 
 
 		 3427 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  29.79 
 
 		 1728 aa  80.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.97 
 
 		 4122 aa  79.7  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  55.95 
 
 		 4334 aa  79.7  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.29 
 
 		 1372 aa  79.7  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 2678 aa  79  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.84 
 
 		 4106 aa  79  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  44.64 
 
 		 729 aa  79  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.53 
 
 		 2337 aa  77.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  39.38 
 
 		 219 aa  78.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  42.28 
 
 		 2251 aa  77.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 652 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.79 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 		 475 aa  77  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.54 
 
 		 4978 aa  75.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  30.87 
 
 		 2060 aa  75.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 2346 aa  75.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  33.01 
 
 		 2704 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.65 
 
 		 3954 aa  75.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  47.73 
 
 		 742 aa  74.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 1073 aa  74.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.85 
 
 		 485 aa  74.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  49.44 
 
 		 1164 aa  74.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.37 
 
 		 1287 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  34.34 
 
 		 5218 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1526 aa  73.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 1175 aa  73.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  47.25 
 
 		 4687 aa  73.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  27.09 
 
 		 7284 aa  73.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.82 
 
 		 1279 aa  73.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.96 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.34 
 
 		 2145 aa  72.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>