More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2777 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
1372 aa  2731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.32 
 
 
1027 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.25 
 
 
419 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.75 
 
 
419 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.17 
 
 
381 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2756  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.49 
 
 
396 aa  255  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.56 
 
 
399 aa  256  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3422  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.24 
 
 
396 aa  254  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236253  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.33 
 
 
588 aa  246  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.95 
 
 
377 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0237  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.06 
 
 
412 aa  240  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.14 
 
 
383 aa  238  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.21 
 
 
389 aa  238  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.26 
 
 
396 aa  237  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.18 
 
 
355 aa  236  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0235433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3256  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.93 
 
 
381 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.15 
 
 
425 aa  231  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0051177  normal  0.272152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.52 
 
 
379 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.48 
 
 
2668 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4261  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.68 
 
 
381 aa  230  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036739  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4105  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.68 
 
 
381 aa  230  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.22 
 
 
373 aa  229  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.26 
 
 
379 aa  229  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.33 
 
 
368 aa  229  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0502  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic precursor protein  40.99 
 
 
378 aa  229  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1750  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.42 
 
 
381 aa  229  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102428  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3685  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.42 
 
 
381 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic  37.09 
 
 
383 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000316579  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4158  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.17 
 
 
381 aa  228  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4329  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.17 
 
 
381 aa  227  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00293344  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.66 
 
 
378 aa  227  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.830481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.88 
 
 
385 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3194  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.05 
 
 
378 aa  225  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.95 
 
 
769 aa  224  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.16 
 
 
392 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.42 
 
 
370 aa  223  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.4 
 
 
378 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2022  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.4 
 
 
378 aa  222  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.779674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.4 
 
 
378 aa  222  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0892  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.4 
 
 
378 aa  222  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.4 
 
 
378 aa  222  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3140  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.4 
 
 
378 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6906  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.13 
 
 
381 aa  221  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.33 
 
 
383 aa  220  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.21 
 
 
395 aa  219  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.89 
 
 
390 aa  218  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.92 
 
 
369 aa  214  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.24 
 
 
397 aa  213  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.11 
 
 
408 aa  212  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7923  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.93 
 
 
358 aa  206  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  61.18 
 
 
417 aa  204  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.01 
 
 
350 aa  202  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.34 
 
 
406 aa  201  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03494  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.36 
 
 
366 aa  195  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.5 
 
 
367 aa  194  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  51.64 
 
 
652 aa  187  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.1 
 
 
333 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4038  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.58 
 
 
371 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.690604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.73 
 
 
360 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1046  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.06 
 
 
375 aa  181  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0245  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.85 
 
 
332 aa  172  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.710509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.01 
 
 
341 aa  169  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.42 
 
 
3427 aa  166  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.33 
 
 
329 aa  164  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.2 
 
 
374 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.45 
 
 
356 aa  161  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.82712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002678  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.19 
 
 
351 aa  158  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0855489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  47.96 
 
 
457 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0859  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.44 
 
 
356 aa  157  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.15 
 
 
547 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  40.23 
 
 
709 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  47.45 
 
 
457 aa  155  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  41.7 
 
 
1175 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.55 
 
 
356 aa  153  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.28 
 
 
355 aa  151  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.17 
 
 
352 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.16 
 
 
356 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2467  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.16 
 
 
356 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.52374  normal  0.0759304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2626  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.16 
 
 
356 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.538824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2522  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.16 
 
 
356 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2418  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.16 
 
 
356 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3177  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.94 
 
 
359 aa  144  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  41.45 
 
 
390 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.81 
 
 
361 aa  141  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 
917 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0224  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.74 
 
 
371 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3992  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.66 
 
 
371 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.220581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.05 
 
 
359 aa  137  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2536  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.89 
 
 
358 aa  136  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3376  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.89 
 
 
358 aa  136  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2391  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.89 
 
 
358 aa  136  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02165  periplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.89 
 
 
358 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02124  hypothetical protein  30.89 
 
 
358 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.31 
 
 
360 aa  134  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  44.68 
 
 
415 aa  134  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1412  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.63 
 
 
358 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.49 
 
 
451 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311266  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.63 
 
 
358 aa  132  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.43101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2621  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.63 
 
 
358 aa  132  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2379  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.63 
 
 
358 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>