More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0262 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
729 aa  1448    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  69.55 
 
 
742 aa  988    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  46.57 
 
 
680 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  42.51 
 
 
736 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  40.47 
 
 
728 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  40.11 
 
 
724 aa  439  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  40.26 
 
 
739 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  35.02 
 
 
717 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
572 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 
639 aa  280  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  35.7 
 
 
620 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.24 
 
 
1279 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.3 
 
 
2954 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.33 
 
 
2667 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.79 
 
 
1164 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.99 
 
 
3427 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.23 
 
 
1424 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.69 
 
 
946 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.55 
 
 
980 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.97 
 
 
595 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.66 
 
 
2668 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 
4334 aa  107  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 
1400 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.22 
 
 
460 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.33 
 
 
2105 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.09 
 
 
833 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
795 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 
526 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.83 
 
 
1363 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
1287 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 
615 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.14 
 
 
1795 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.01 
 
 
2145 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 
1895 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.44 
 
 
950 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  40.27 
 
 
741 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 
1534 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.83 
 
 
280 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.83 
 
 
280 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.9 
 
 
1236 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
341 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.81 
 
 
9867 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.2 
 
 
1963 aa  99.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.24 
 
 
686 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  40.27 
 
 
734 aa  99  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  45.86 
 
 
679 aa  98.2  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  44.72 
 
 
355 aa  98.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  41.01 
 
 
257 aa  98.6  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
341 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  42.94 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  37.57 
 
 
709 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 
813 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  45.11 
 
 
585 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  33.89 
 
 
460 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.67 
 
 
2885 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  38.6 
 
 
938 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.94 
 
 
3619 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.97 
 
 
1016 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 
361 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 
424 aa  94.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 
387 aa  94  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.9 
 
 
3619 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 
327 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
982 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  44.36 
 
 
582 aa  93.6  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 
686 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 
824 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 
260 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  35.71 
 
 
850 aa  93.2  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.84 
 
 
588 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  41.88 
 
 
4687 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 
243 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.02 
 
 
1532 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  31.93 
 
 
589 aa  91.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  36.59 
 
 
4800 aa  90.9  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.55 
 
 
757 aa  90.1  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.07 
 
 
421 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  30.83 
 
 
387 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
232 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.18 
 
 
219 aa  89  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  36.41 
 
 
5171 aa  89.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.77 
 
 
606 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  31.85 
 
 
361 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  31.85 
 
 
361 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 
363 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.57 
 
 
518 aa  88.2  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
245 aa  88.2  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  33.84 
 
 
942 aa  88.2  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.91 
 
 
1712 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 
385 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  40.13 
 
 
1383 aa  87.4  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.8 
 
 
219 aa  87.4  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.54 
 
 
2689 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  32.4 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.6 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.91 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.47 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  46.49 
 
 
2336 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.6 
 
 
3954 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  43.31 
 
 
998 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>