247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1979 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 3038 aa  6025    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 		 2478 aa  322  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  34.02 
 
 		 2887 aa  209  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 		 2524 aa  149  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.87 
 
 		 1553 aa  118  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  27.85 
 
 		 1867 aa  117  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 5009 aa  115  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.75 
 
 		 4285 aa  112  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  31.77 
 
 		 2825 aa  107  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.87 
 
 		 4836 aa  104  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  30.67 
 
 		 1598 aa  104  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 2452 aa  103  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  27.92 
 
 		 2127 aa  103  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 2812 aa  101  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 2239 aa  100  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  28.68 
 
 		 4854 aa  94  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 1232 aa  93.2  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  26.3 
 
 		 6211 aa  93.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 		 4748 aa  92.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 		 2067 aa  92.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  46.76 
 
 		 2537 aa  89.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  25.65 
 
 		 3923 aa  88.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 4220 aa  87.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  36.08 
 
 		 4214 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.65 
 
 		 5123 aa  84.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.24 
 
 		 5098 aa  84  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 		 6006 aa  83.2  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.72 
 
 		 1599 aa  83.2  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 		 3259 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.42 
 
 		 16311 aa  81.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.46 
 
 		 7149 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.09 
 
 		 4122 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  31.88 
 
 		 3182 aa  80.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1350 aa  80.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  24.23 
 
 		 5451 aa  79.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  31.62 
 
 		 3263 aa  79  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  33.16 
 
 		 4791 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 6683 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 6662 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  24.24 
 
 		 6310 aa  77.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  24.24 
 
 		 8064 aa  77.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 6779 aa  77.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 3229 aa  75.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.43 
 
 		 5769 aa  74.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.69 
 
 		 2768 aa  74.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 16322 aa  73.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.7 
 
 		 2784 aa  72.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.54 
 
 		 2836 aa  72.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  22.86 
 
 		 2743 aa  72.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  32.18 
 
 		 2329 aa  72.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  37.16 
 
 		 2456 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  25.43 
 
 		 7233 aa  69.7  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 2337 aa  69.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  43.42 
 
 		 2060 aa  68.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.34 
 
 		 1883 aa  67.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.51 
 
 		 2251 aa  67.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 2678 aa  68.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1538 aa  65.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31.55 
 
 		 3508 aa  65.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  35.52 
 
 		 2625 aa  65.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.68 
 
 		 1141 aa  64.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 11716 aa  64.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.81 
 
 		 5442 aa  63.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 1728 aa  62.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  43.84 
 
 		 3714 aa  62.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.5 
 
 		 2507 aa  62.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  35.25 
 
 		 3026 aa  61.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1806 aa  62  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 		 272 aa  60.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  25.84 
 
 		 2202 aa  60.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  37.24 
 
 		 1884 aa  60.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  28.94 
 
 		 2336 aa  60.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.76 
 
 		 3598 aa  60.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2337  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1035 aa  59.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1424 aa  59.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  35.78 
 
 		 276 aa  58.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  30.77 
 
 		 2890 aa  58.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.18 
 
 		 2812 aa  58.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  35.77 
 
 		 3824 aa  57.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  35.77 
 
 		 3824 aa  57.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.33 
 
 		 3314 aa  56.6  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  35.77 
 
 		 3739 aa  56.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  31.2 
 
 		 1706 aa  56.2  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  26.09 
 
 		 3184 aa  56.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1699 aa  56.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.13 
 
 		 3209 aa  55.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  33.92 
 
 		 741 aa  55.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  37.61 
 
 		 236 aa  55.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  40.18 
 
 		 518 aa  55.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.8 
 
 		 485 aa  55.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  44.83 
 
 		 2178 aa  55.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 467 aa  55.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.96 
 
 		 3721 aa  54.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  40.19 
 
 		 236 aa  54.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.96 
 
 		 3824 aa  54.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  38.16 
 
 		 277 aa  54.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  37.6 
 
 		 540 aa  54.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  56.52 
 
 		 709 aa  53.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  35.81 
 
 		 513 aa  54.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  36.19 
 
 		 261 aa  54.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>