50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3480 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  83.03 
 
 		 277 aa  470  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  34 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  32.16 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  45.08 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  41.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  42.02 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  40.26 
 
 		 3508 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  40 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  40.48 
 
 		 3714 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  33.72 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  41.35 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  40.38 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  36.36 
 
 		 2060 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.78 
 
 		 3038 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.54 
 
 		 2678 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  42.42 
 
 		 5094 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  42.86 
 
 		 4854 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 2067 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  35.16 
 
 		 2524 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 5098 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.46 
 
 		 1883 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  44.26 
 
 		 16311 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  30.28 
 
 		 2887 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  54.9 
 
 		 2784 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  36.99 
 
 		 3182 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  40.98 
 
 		 6678 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.27 
 
 		 3091 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  38.71 
 
 		 1586 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  41.27 
 
 		 3259 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.75 
 
 		 1553 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  33.33 
 
 		 1706 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.49 
 
 		 14916 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  34.18 
 
 		 5451 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  40.32 
 
 		 7149 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  34.26 
 
 		 3026 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  31.01 
 
 		 4748 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  41.18 
 
 		 6581 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  32.47 
 
 		 6310 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 		 3229 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  32.05 
 
 		 8064 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  32.43 
 
 		 3923 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  37.93 
 
 		 2567 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.52 
 
 		 3758 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  30.27 
 
 		 2743 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  34.02 
 
 		 3739 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.02 
 
 		 3824 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.02 
 
 		 3721 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  34.02 
 
 		 3824 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  34.02 
 
 		 3824 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>