32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2017 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  86.91 
 
 
277 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  34 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  34.68 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  43.1 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  43.59 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  42.74 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  42.24 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  38.97 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.62 
 
 
16311 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
2067 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  38.81 
 
 
4854 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  30.3 
 
 
3714 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
3508 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.45 
 
 
3038 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.36 
 
 
5094 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 
3259 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 
1599 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  33.33 
 
 
3182 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.67 
 
 
541 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  30.69 
 
 
3229 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  29.63 
 
 
3758 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.92 
 
 
6678 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  37.93 
 
 
2555 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 
2337 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.66 
 
 
5098 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  33.87 
 
 
2784 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.64 
 
 
537 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 
1553 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 
2524 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>