117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0830 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  95.1 
 
 		 6310 aa  10840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  33.88 
 
 		 2456 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  100 
 
 		 8064 aa  15130    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  33.19 
 
 		 2625 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  88.41 
 
 		 5451 aa  8650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  75.01 
 
 		 3923 aa  5115    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.94 
 
 		 3721 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.68 
 
 		 3824 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.86 
 
 		 3824 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.56 
 
 		 3824 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.87 
 
 		 6715 aa  622  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.33 
 
 		 3739 aa  607  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.12 
 
 		 3552 aa  530  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  32.58 
 
 		 2704 aa  402  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.45 
 
 		 3562 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.3 
 
 		 3314 aa  235  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.27 
 
 		 4106 aa  234  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  26.42 
 
 		 3325 aa  218  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.26 
 
 		 4689 aa  210  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.12 
 
 		 2927 aa  194  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  28.15 
 
 		 4430 aa  146  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.75 
 
 		 5080 aa  144  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.37 
 
 		 5561 aa  124  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.88 
 
 		 4480 aa  122  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.5 
 
 		 5561 aa  120  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.71 
 
 		 5559 aa  114  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.53 
 
 		 5559 aa  114  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.8 
 
 		 5561 aa  114  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.69 
 
 		 2402 aa  112  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.11 
 
 		 3204 aa  106  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1278 aa  100  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  26.17 
 
 		 3736 aa  91.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.71 
 
 		 3038 aa  89.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1019 aa  85.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  28.01 
 
 		 2202 aa  85.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  25.42 
 
 		 3734 aa  84.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.9 
 
 		 5098 aa  82.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  32.74 
 
 		 4672 aa  80.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.79 
 
 		 2911 aa  79.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.29 
 
 		 4874 aa  79.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  25.23 
 
 		 4428 aa  78.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  30.5 
 
 		 1301 aa  75.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  29.19 
 
 		 500 aa  75.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.47 
 
 		 1462 aa  71.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0284  hypothetical protein  35.21 
 
 		 347 aa  70.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.28 
 
 		 1461 aa  70.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1196  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 		 3173 aa  67.8  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.06 
 
 		 2807 aa  67.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  38.85 
 
 		 1706 aa  67.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2169  hypothetical protein  35.45 
 
 		 637 aa  65.9  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.225639  normal  0.195248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 		 4334 aa  65.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  27.94 
 
 		 2768 aa  64.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  30.15 
 
 		 3340 aa  63.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  24.88 
 
 		 5444 aa  63.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.62 
 
 		 11716 aa  62.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  27.05 
 
 		 850 aa  62  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.53 
 
 		 2507 aa  62.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 2537 aa  62  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 1867 aa  62  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 		 4836 aa  60.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 6662 aa  60.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.1 
 
 		 3954 aa  60.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1207 aa  60.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.41 
 
 		 898 aa  59.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.32 
 
 		 913 aa  59.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 6683 aa  60.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  27.11 
 
 		 888 aa  59.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 6779 aa  60.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1286 aa  59.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  32.1 
 
 		 959 aa  59.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  32.74 
 
 		 539 aa  59.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.39 
 
 		 1597 aa  58.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 		 2825 aa  58.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  40.67 
 
 		 747 aa  58.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.84 
 
 		 3586 aa  57.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 		 2346 aa  56.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.37 
 
 		 5216 aa  56.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  36.64 
 
 		 2329 aa  56.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 		 2478 aa  56.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.6 
 
 		 1141 aa  56.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 		 2452 aa  56.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  29.01 
 
 		 2796 aa  55.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.11 
 
 		 3925 aa  55.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1912  hypothetical protein  32.65 
 
 		 709 aa  55.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0466434  normal  0.0319715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  50 
 
 		 16311 aa  54.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  31.47 
 
 		 906 aa  54.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  27.44 
 
 		 4748 aa  53.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 		 2198 aa  53.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.61 
 
 		 1586 aa  53.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  49.23 
 
 		 3508 aa  53.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.8 
 
 		 680 aa  52.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  31.58 
 
 		 714 aa  52.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  35.66 
 
 		 4791 aa  51.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.95 
 
 		 4220 aa  52  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.92 
 
 		 1884 aa  51.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.89 
 
 		 3714 aa  50.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 16322 aa  50.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.9 
 
 		 1855 aa  50.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  33.86 
 
 		 2890 aa  50.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3434  metallophosphoesterase  22.73 
 
 		 1327 aa  49.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>