82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2918 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1358    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  30.58 
 
 
500 aa  99  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.05 
 
 
2839 aa  84.3  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  34.41 
 
 
4689 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  33.01 
 
 
3562 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.98 
 
 
2456 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  32.18 
 
 
911 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.72 
 
 
2715 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  34.51 
 
 
4874 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31.54 
 
 
2625 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.67 
 
 
3325 aa  70.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.28 
 
 
3824 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.28 
 
 
3824 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.44 
 
 
3721 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.96 
 
 
3314 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.28 
 
 
3824 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.5 
 
 
2927 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.84 
 
 
1505 aa  65.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.65 
 
 
3552 aa  63.9  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.24 
 
 
964 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.82 
 
 
4106 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  32.66 
 
 
2704 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.59 
 
 
1461 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.29 
 
 
7149 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  37.33 
 
 
6715 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  27.12 
 
 
3333 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  32.16 
 
 
8064 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  31.4 
 
 
5451 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  25.56 
 
 
2344 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  29.53 
 
 
1657 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3186  hypothetical protein  34.03 
 
 
686 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.958753  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.19 
 
 
6310 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  25.2 
 
 
653 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.86 
 
 
3586 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.13 
 
 
3739 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  33.83 
 
 
916 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.63 
 
 
4480 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.44 
 
 
2768 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  24.91 
 
 
1795 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  34.04 
 
 
1121 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.58 
 
 
5559 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.58 
 
 
5559 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.58 
 
 
5561 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  32.86 
 
 
3923 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  33.76 
 
 
1278 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.64 
 
 
2042 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 
6779 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  36.67 
 
 
739 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 
6662 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.12 
 
 
898 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 
6683 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.85 
 
 
899 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.42 
 
 
5561 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 
964 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  31.07 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.95 
 
 
3227 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.42 
 
 
5561 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.03 
 
 
5216 aa  48.5  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.92 
 
 
4761 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.73 
 
 
5171 aa  48.5  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.47 
 
 
892 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  34.51 
 
 
1222 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  32.82 
 
 
312 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  44.55 
 
 
635 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  29.28 
 
 
3734 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  33.59 
 
 
2911 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  33.59 
 
 
3204 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.71 
 
 
831 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  28.01 
 
 
1951 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  31.12 
 
 
3736 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  31.76 
 
 
1804 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  30.87 
 
 
5080 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.05 
 
 
3925 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.88 
 
 
2117 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  30.05 
 
 
4748 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.52 
 
 
1061 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  34.19 
 
 
1047 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  29.66 
 
 
850 aa  45.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.06 
 
 
5442 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  33.96 
 
 
549 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.85 
 
 
2402 aa  43.9  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  33.47 
 
 
1439 aa  43.9  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>