23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1196 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1196  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 3173 aa  6230    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0433  surface protein Rib  29.8 
 
 		 1389 aa  92.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  31.83 
 
 		 2457 aa  82.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1671  hypothetical protein  32.79 
 
 		 2552 aa  74.7  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1482  cell wall surface anchor family protein  23.2 
 
 		 1973 aa  70.1  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  28.57 
 
 		 8064 aa  68.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.31 
 
 		 6310 aa  57.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  26.15 
 
 		 3923 aa  57  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 		 3552 aa  55.5  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  49.12 
 
 		 4430 aa  53.9  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  26.32 
 
 		 5451 aa  53.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  29.26 
 
 		 2456 aa  52.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0142  adhesion exoprotein  28.45 
 
 		 2223 aa  51.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.39 
 
 		 2402 aa  50.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.13 
 
 		 3824 aa  50.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.13 
 
 		 3824 aa  50.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1495  hypothetical protein  27.22 
 
 		 10624 aa  49.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1524  hypothetical protein  27.22 
 
 		 10624 aa  49.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.53 
 
 		 2625 aa  49.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.56 
 
 		 3824 aa  49.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.96 
 
 		 3739 aa  47.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  31.4 
 
 		 10203 aa  47.8  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.74 
 
 		 3721 aa  47.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>