161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3017 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.96 
 
 		 4106 aa  1507    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  86.3 
 
 		 3824 aa  5729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  100 
 
 		 3739 aa  7241    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.08 
 
 		 2456 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  34.2 
 
 		 3562 aa  938    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.96 
 
 		 3552 aa  2432    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  89.37 
 
 		 3721 aa  6261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  86.72 
 
 		 3824 aa  5710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.67 
 
 		 3516 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  86.53 
 
 		 3824 aa  5740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  34.2 
 
 		 2625 aa  705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.22 
 
 		 3325 aa  850    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 2704 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.16 
 
 		 5451 aa  626  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  29.71 
 
 		 3923 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  31.18 
 
 		 8064 aa  607  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  31.08 
 
 		 6310 aa  593  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  29.73 
 
 		 4430 aa  535  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.42 
 
 		 3204 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.09 
 
 		 4480 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.37 
 
 		 5561 aa  471  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.26 
 
 		 5561 aa  463  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.3 
 
 		 5559 aa  457  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.34 
 
 		 5559 aa  457  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.27 
 
 		 5561 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  30.81 
 
 		 2911 aa  364  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  28.7 
 
 		 5080 aa  362  9.999999999999999e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 		 2927 aa  330  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.22 
 
 		 7149 aa  302  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.35 
 
 		 3314 aa  296  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 		 6662 aa  287  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.56 
 
 		 4689 aa  286  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.81 
 
 		 6715 aa  279  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 6779 aa  269  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.19 
 
 		 4874 aa  259  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 		 6683 aa  248  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1278 aa  227  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  29.61 
 
 		 1461 aa  186  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  35.56 
 
 		 959 aa  135  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.09 
 
 		 3736 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.54 
 
 		 3586 aa  133  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.62 
 
 		 5171 aa  132  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.56 
 
 		 2402 aa  129  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.47 
 
 		 1586 aa  122  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3734 aa  117  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  26.78 
 
 		 4791 aa  114  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 		 5216 aa  111  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.85 
 
 		 5839 aa  108  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  34.14 
 
 		 739 aa  100  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  36.03 
 
 		 1529 aa  100  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  39.78 
 
 		 635 aa  99.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.55 
 
 		 2839 aa  97.1  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.2 
 
 		 5442 aa  89.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  26.43 
 
 		 1424 aa  83.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.74 
 
 		 2768 aa  82.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.85 
 
 		 1096 aa  82.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  29.05 
 
 		 1092 aa  81.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  36.21 
 
 		 747 aa  79.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.2 
 
 		 4678 aa  79.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  24.56 
 
 		 1951 aa  79  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.61 
 
 		 5745 aa  77.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.21 
 
 		 800 aa  77  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  24.92 
 
 		 5444 aa  75.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1019 aa  75.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1869 aa  74.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  26.76 
 
 		 850 aa  74.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.14 
 
 		 1695 aa  74.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  26.6 
 
 		 2193 aa  73.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  30.42 
 
 		 606 aa  73.2  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  25.82 
 
 		 2552 aa  72.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  30.74 
 
 		 4672 aa  72.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.21 
 
 		 5743 aa  72  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  33.12 
 
 		 747 aa  71.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.31 
 
 		 1219 aa  70.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.29 
 
 		 913 aa  70.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.65 
 
 		 3477 aa  70.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.53 
 
 		 2715 aa  69.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  32.22 
 
 		 499 aa  69.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.65 
 
 		 898 aa  68.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.41 
 
 		 899 aa  67.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.17 
 
 		 1332 aa  67  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  27.89 
 
 		 4214 aa  67.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  27.63 
 
 		 888 aa  65.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  27.06 
 
 		 1428 aa  64.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.73 
 
 		 376 aa  63.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  30.43 
 
 		 823 aa  63.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  29.07 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 361 aa  62.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  28.5 
 
 		 352 aa  62  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.06 
 
 		 6885 aa  62  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  31.98 
 
 		 562 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1792 aa  62  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  38.14 
 
 		 2890 aa  60.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  30.37 
 
 		 711 aa  60.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1452 aa  60.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  27.6 
 
 		 3925 aa  60.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  30.49 
 
 		 670 aa  60.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  29.34 
 
 		 916 aa  59.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1061 aa  59.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  27.51 
 
 		 339 aa  59.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>