128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1029 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1529 aa  3061    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  98.1 
 
 		 3516 aa  503  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.95 
 
 		 4106 aa  161  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.1 
 
 		 3552 aa  105  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.51 
 
 		 7149 aa  102  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  31.71 
 
 		 3562 aa  100  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  31.51 
 
 		 3824 aa  100  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  36.03 
 
 		 3739 aa  100  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  36.03 
 
 		 3721 aa  99.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  36.03 
 
 		 3824 aa  99.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  35.66 
 
 		 3824 aa  98.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.02 
 
 		 3325 aa  95.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1278 aa  85.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 		 2704 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.44 
 
 		 2927 aa  83.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.08 
 
 		 5962 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  25.98 
 
 		 5218 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  32.74 
 
 		 3204 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1096 aa  75.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  34.5 
 
 		 739 aa  74.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.33 
 
 		 3314 aa  73.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.67 
 
 		 4480 aa  73.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  29.71 
 
 		 4214 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  33.33 
 
 		 635 aa  72  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  24.47 
 
 		 6753 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.2 
 
 		 1867 aa  69.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  24.93 
 
 		 9030 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  25.2 
 
 		 8682 aa  68.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  30.46 
 
 		 5561 aa  68.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.06 
 
 		 6683 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  31.21 
 
 		 2911 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.06 
 
 		 6662 aa  67  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  30.19 
 
 		 5561 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.95 
 
 		 5561 aa  66.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.1 
 
 		 6779 aa  65.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  30.19 
 
 		 5559 aa  65.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  30.19 
 
 		 5559 aa  65.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.4 
 
 		 4848 aa  63.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.2 
 
 		 5080 aa  64.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.87 
 
 		 5839 aa  63.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  52 
 
 		 2768 aa  62  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.25 
 
 		 4836 aa  61.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  26.92 
 
 		 4430 aa  61.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.15 
 
 		 5787 aa  60.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1699 aa  60.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.26 
 
 		 5442 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.53 
 
 		 675 aa  60.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.53 
 
 		 4122 aa  59.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  26.83 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.61 
 
 		 1332 aa  58.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  31.04 
 
 		 4689 aa  58.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  26.18 
 
 		 499 aa  57.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.89 
 
 		 1079 aa  58.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.23 
 
 		 5171 aa  58.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.04 
 
 		 3927 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25.5 
 
 		 1269 aa  57.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  29.4 
 
 		 4791 aa  56.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  48.65 
 
 		 5444 aa  57  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  23.91 
 
 		 1268 aa  57  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  32.12 
 
 		 16311 aa  56.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.12 
 
 		 5216 aa  55.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  44 
 
 		 2524 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 		 507 aa  54.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.29 
 
 		 1141 aa  53.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.61 
 
 		 1219 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  41.56 
 
 		 486 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 2239 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  43.96 
 
 		 8321 aa  52.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 547 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.52 
 
 		 3227 aa  52  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  46.34 
 
 		 4285 aa  51.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  45.21 
 
 		 938 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  29.26 
 
 		 482 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 		 16322 aa  51.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  47.83 
 
 		 1706 aa  50.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.94 
 
 		 553 aa  50.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  43.53 
 
 		 2133 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  43.53 
 
 		 2198 aa  50.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38 
 
 		 4220 aa  50.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  27.01 
 
 		 1582 aa  50.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  44.29 
 
 		 462 aa  49.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  42.67 
 
 		 504 aa  50.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 221 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  41.67 
 
 		 476 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  41.24 
 
 		 2542 aa  49.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  26.16 
 
 		 833 aa  49.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.85 
 
 		 1269 aa  49.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  43.84 
 
 		 1502 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  42.11 
 
 		 476 aa  48.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.22 
 
 		 1586 aa  48.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  40 
 
 		 2743 aa  48.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  44.29 
 
 		 448 aa  48.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  43.21 
 
 		 479 aa  48.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  36.26 
 
 		 442 aa  48.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  36.26 
 
 		 444 aa  48.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  36.26 
 
 		 444 aa  48.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.56 
 
 		 3259 aa  48.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 980 aa  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  40.28 
 
 		 475 aa  47.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  35.65 
 
 		 1757 aa  47.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>