167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0068 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
1695 aa  3417    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30.36 
 
 
5743 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  30.61 
 
 
1462 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.99 
 
 
6885 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  25.74 
 
 
2704 aa  100  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.25 
 
 
1332 aa  98.2  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  25.16 
 
 
4689 aa  92.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.29 
 
 
680 aa  86.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  23.8 
 
 
5559 aa  85.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  23.8 
 
 
5559 aa  85.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  24.5 
 
 
3562 aa  84.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  23.95 
 
 
5561 aa  85.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  23.77 
 
 
2552 aa  83.2  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.71 
 
 
3552 aa  82.8  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.7 
 
 
5561 aa  82.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.7 
 
 
5561 aa  80.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  36.07 
 
 
1199 aa  80.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  23.5 
 
 
4106 aa  79.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  24.36 
 
 
3824 aa  76.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  24.25 
 
 
3824 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.14 
 
 
3739 aa  73.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  24.63 
 
 
3824 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  24.46 
 
 
3721 aa  73.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  24.63 
 
 
3586 aa  73.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.09 
 
 
1219 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  24.51 
 
 
3325 aa  72.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  35.68 
 
 
782 aa  70.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  26.89 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  26.46 
 
 
1047 aa  67.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  23.96 
 
 
4430 aa  67.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.02 
 
 
2927 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  24.27 
 
 
1461 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  33.18 
 
 
5080 aa  66.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 
1401 aa  66.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  36.14 
 
 
1401 aa  65.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  23.07 
 
 
1951 aa  63.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  25.11 
 
 
744 aa  62  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  22.68 
 
 
4874 aa  61.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.62 
 
 
1143 aa  60.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.29 
 
 
1570 aa  61.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.54 
 
 
2170 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  29.21 
 
 
1141 aa  60.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.12 
 
 
2042 aa  60.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  23.81 
 
 
1428 aa  60.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  22.98 
 
 
1096 aa  60.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.22 
 
 
480 aa  59.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.66 
 
 
1570 aa  59.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  34.41 
 
 
743 aa  59.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  24.13 
 
 
1424 aa  58.9  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.18 
 
 
3822 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  28.57 
 
 
1042 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.95 
 
 
2068 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  22.57 
 
 
1457 aa  57  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  40 
 
 
1307 aa  57  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.74 
 
 
3802 aa  55.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29 
 
 
1628 aa  55.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  25.83 
 
 
675 aa  55.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  23.56 
 
 
913 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.49 
 
 
5216 aa  54.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  35.71 
 
 
354 aa  54.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.99 
 
 
1887 aa  54.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  21.88 
 
 
3925 aa  54.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  37.78 
 
 
948 aa  53.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.12 
 
 
459 aa  53.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  42.39 
 
 
1847 aa  53.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.21 
 
 
3027 aa  53.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3749  fibronectin, type III domain protein  36.43 
 
 
256 aa  53.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  24.65 
 
 
2456 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  34.22 
 
 
973 aa  53.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  36.23 
 
 
220 aa  52.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  24.22 
 
 
1554 aa  52.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  23.53 
 
 
549 aa  52.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.33 
 
 
455 aa  52  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.61 
 
 
3227 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  44.23 
 
 
226 aa  51.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  21.52 
 
 
1224 aa  52  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  34.43 
 
 
680 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  29.31 
 
 
1067 aa  51.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  28.18 
 
 
1285 aa  51.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  32.18 
 
 
385 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  29.41 
 
 
777 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 
224 aa  51.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  29.41 
 
 
404 aa  51.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.02 
 
 
9585 aa  51.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
458 aa  50.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 
224 aa  51.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.04 
 
 
455 aa  50.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.33 
 
 
455 aa  50.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  23.59 
 
 
2911 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.04 
 
 
455 aa  50.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  23.73 
 
 
3204 aa  50.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  29.36 
 
 
454 aa  50.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.33 
 
 
455 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  26.89 
 
 
404 aa  50.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  23.53 
 
 
444 aa  50.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  24.83 
 
 
711 aa  49.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  34.62 
 
 
481 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  37.7 
 
 
468 aa  49.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1917  hypothetical protein  27.41 
 
 
412 aa  49.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  38.27 
 
 
1753 aa  49.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>