More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2327 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 1847 aa  803    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  38.83 
 
 		 1753 aa  766    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  51.26 
 
 		 1307 aa  1208    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 1401 aa  2852    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  90.72 
 
 		 1401 aa  2615    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 1643 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  33.5 
 
 		 1299 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  33.69 
 
 		 914 aa  357  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.66 
 
 		 1175 aa  355  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  31.86 
 
 		 606 aa  333  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  31.79 
 
 		 651 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.95 
 
 		 1193 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  36.56 
 
 		 586 aa  290  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  31.77 
 
 		 1145 aa  285  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.92 
 
 		 477 aa  276  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 481 aa  270  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  34.2 
 
 		 481 aa  268  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  30.72 
 
 		 574 aa  264  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  34.53 
 
 		 472 aa  261  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  33.52 
 
 		 481 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  31.81 
 
 		 588 aa  259  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.65 
 
 		 727 aa  256  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  33.27 
 
 		 493 aa  255  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  33.02 
 
 		 484 aa  255  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 586 aa  253  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 		 587 aa  251  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  32.5 
 
 		 481 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  31.28 
 
 		 488 aa  248  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 582 aa  248  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 		 589 aa  247  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  30.54 
 
 		 663 aa  246  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  30.35 
 
 		 486 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 486 aa  246  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  30.22 
 
 		 481 aa  245  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  30.35 
 
 		 486 aa  245  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  28.22 
 
 		 600 aa  244  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  30.74 
 
 		 608 aa  243  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  33.4 
 
 		 496 aa  236  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  29.13 
 
 		 610 aa  235  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  29.27 
 
 		 586 aa  231  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.3 
 
 		 586 aa  231  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  31.38 
 
 		 459 aa  231  7e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  29.62 
 
 		 610 aa  230  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  27.99 
 
 		 659 aa  229  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 487 aa  228  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.04 
 
 		 586 aa  226  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.04 
 
 		 586 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.51 
 
 		 575 aa  225  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  29.28 
 
 		 586 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  29.28 
 
 		 586 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  29.28 
 
 		 586 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  29.28 
 
 		 586 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  29.67 
 
 		 589 aa  224  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.09 
 
 		 586 aa  222  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  28.9 
 
 		 586 aa  221  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 617 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  32.63 
 
 		 614 aa  219  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  31.73 
 
 		 611 aa  218  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  29.35 
 
 		 584 aa  218  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.23 
 
 		 574 aa  218  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  30.45 
 
 		 605 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  30.45 
 
 		 605 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.45 
 
 		 605 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  30.62 
 
 		 605 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  30.62 
 
 		 605 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  30.62 
 
 		 605 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  30.62 
 
 		 605 aa  216  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 		 608 aa  215  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.55 
 
 		 1331 aa  214  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  30.43 
 
 		 604 aa  214  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  30.39 
 
 		 605 aa  214  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  32.02 
 
 		 715 aa  214  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  31.31 
 
 		 580 aa  212  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  32.51 
 
 		 578 aa  210  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  30.75 
 
 		 605 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  30.75 
 
 		 605 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  30.17 
 
 		 607 aa  208  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  32.85 
 
 		 476 aa  206  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  30.23 
 
 		 605 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  29.64 
 
 		 605 aa  207  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.97 
 
 		 1176 aa  204  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 483 aa  204  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 703 aa  203  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 576 aa  201  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  28.85 
 
 		 609 aa  195  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  28.85 
 
 		 609 aa  195  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.75 
 
 		 1891 aa  194  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 622 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.17 
 
 		 635 aa  192  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.84 
 
 		 480 aa  188  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  28.22 
 
 		 475 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  28.68 
 
 		 474 aa  186  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 583 aa  186  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 479 aa  185  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  48.51 
 
 		 1005 aa  180  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 562 aa  179  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.99 
 
 		 1975 aa  178  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 473 aa  175  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  27.03 
 
 		 473 aa  175  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27 
 
 		 576 aa  175  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>