More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3073 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 477 aa  995    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  50.11 
 
 		 481 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  47 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  51.54 
 
 		 574 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  47.89 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  47.03 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  46.32 
 
 		 589 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  46.12 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  48.19 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  46.37 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  45.89 
 
 		 586 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  45.89 
 
 		 586 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  45.88 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  46.59 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  46.2 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  44.4 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  46.05 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  45.77 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  45.24 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  45.03 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  45.24 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  45.24 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  45.32 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  47.2 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  45.24 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  45.03 
 
 		 586 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  44.61 
 
 		 586 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  43.15 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  43.93 
 
 		 610 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  45.03 
 
 		 586 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  44.14 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  44.94 
 
 		 583 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  46.47 
 
 		 584 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  43.14 
 
 		 574 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  43.69 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  37.18 
 
 		 575 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  38.78 
 
 		 663 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  44.34 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  43.87 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  44.17 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  44.64 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 578 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  36.35 
 
 		 1847 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  37.38 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  32.39 
 
 		 1401 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.92 
 
 		 1401 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  37.22 
 
 		 617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  34.91 
 
 		 600 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 703 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 1299 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  32.07 
 
 		 659 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  35.84 
 
 		 614 aa  266  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  32.63 
 
 		 1643 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  32.71 
 
 		 914 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 1307 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  33.41 
 
 		 651 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.01 
 
 		 1193 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.68 
 
 		 1175 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  31.75 
 
 		 606 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  33.6 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  33.26 
 
 		 608 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  31.42 
 
 		 475 aa  250  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  38.79 
 
 		 715 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 611 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  31.49 
 
 		 644 aa  243  7e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  32.17 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  31.56 
 
 		 1753 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  34.76 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  34.74 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  34.74 
 
 		 609 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  32.35 
 
 		 608 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  34.4 
 
 		 605 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  33.97 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  33.33 
 
 		 605 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  33.76 
 
 		 605 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  30.9 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  33.33 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  34.1 
 
 		 580 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  32.69 
 
 		 605 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  32.69 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  32.69 
 
 		 605 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  32.69 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  32.69 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  32.69 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  32.69 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  32.48 
 
 		 604 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 1145 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  32.57 
 
 		 576 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 635 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  31.46 
 
 		 622 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 		 562 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4128  alpha amylase catalytic region  29.7 
 
 		 1012 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0625116  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1393  alpha amylase catalytic region  30.66 
 
 		 1016 aa  192  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>