More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0794 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
562 aa  1130    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 
635 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  40.26 
 
 
622 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  31.99 
 
 
610 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  32.11 
 
 
610 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  34.07 
 
 
589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 
582 aa  217  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 
588 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 
574 aa  213  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  32.15 
 
 
575 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  32.65 
 
 
576 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  30.09 
 
 
496 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  33.66 
 
 
584 aa  206  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  31.76 
 
 
586 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  32.29 
 
 
586 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  29.56 
 
 
644 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  32.29 
 
 
586 aa  204  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  32.48 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.87 
 
 
510 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  33.01 
 
 
589 aa  200  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  32.32 
 
 
511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  31.18 
 
 
586 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  31.96 
 
 
587 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  31.18 
 
 
586 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  31.26 
 
 
586 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  31.18 
 
 
586 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  29.13 
 
 
477 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  31.18 
 
 
586 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  30.96 
 
 
586 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.96 
 
 
586 aa  190  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.18 
 
 
481 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 
473 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  29.27 
 
 
473 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  30.98 
 
 
578 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 
1401 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 
541 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.63 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 
1401 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 
545 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 
583 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.51 
 
 
606 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 
481 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  29.64 
 
 
472 aa  179  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  30.68 
 
 
515 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  29.71 
 
 
481 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.49 
 
 
574 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 
593 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  29.27 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  28.6 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  27.88 
 
 
608 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 
487 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  31.64 
 
 
474 aa  170  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  27.77 
 
 
595 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 
481 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 
486 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  26.65 
 
 
1193 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  28.51 
 
 
484 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 
486 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 
583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  26.01 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  30.94 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  27.7 
 
 
663 aa  164  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30 
 
 
479 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 
558 aa  163  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 
488 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.51 
 
 
654 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 
499 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 
528 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 
608 aa  161  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  27.65 
 
 
605 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 
493 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 
528 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 
576 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 
614 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  30.45 
 
 
463 aa  159  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 
459 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 
543 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  25.15 
 
 
605 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  25.15 
 
 
605 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 
509 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  27.43 
 
 
1175 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 
703 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  24.9 
 
 
605 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 
659 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  25.88 
 
 
580 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  25 
 
 
607 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  24.7 
 
 
605 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.64 
 
 
533 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  26.77 
 
 
590 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 
1753 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 
434 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  24.89 
 
 
609 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  24.89 
 
 
609 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 
1307 aa  150  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  25.71 
 
 
605 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  25.71 
 
 
605 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>