More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3205 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  58.68 
 
 		 593 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 583 aa  1191    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  58.39 
 
 		 595 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  47.44 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  48.62 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  47.98 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  47.83 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  45.83 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  41.79 
 
 		 522 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  40.61 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  39.13 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  36.76 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  35.91 
 
 		 493 aa  279  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  32.13 
 
 		 575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  34.42 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  34.05 
 
 		 606 aa  266  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  34.72 
 
 		 577 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  33.91 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  33.94 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  35.29 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  34.19 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  33.79 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  32.89 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  33.71 
 
 		 682 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  33.94 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  33.83 
 
 		 587 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  33.69 
 
 		 591 aa  259  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  35.15 
 
 		 538 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  34.92 
 
 		 601 aa  259  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  35.35 
 
 		 572 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  35.15 
 
 		 572 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  33.4 
 
 		 588 aa  259  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  35.15 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  33.47 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  33.15 
 
 		 610 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  31.82 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 		 562 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  33.33 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  33.76 
 
 		 536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  33.6 
 
 		 1138 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  32.94 
 
 		 567 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  33.6 
 
 		 1136 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  36.44 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  33.78 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1137 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  33.4 
 
 		 1137 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1115 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1137 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  33.14 
 
 		 591 aa  251  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  33.73 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  33 
 
 		 1137 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  33.4 
 
 		 524 aa  250  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  33.53 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  33.74 
 
 		 572 aa  250  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  36.23 
 
 		 555 aa  249  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  32.43 
 
 		 596 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  32.43 
 
 		 596 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  34.33 
 
 		 1088 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  33.2 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  34.33 
 
 		 1088 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  33 
 
 		 1137 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  33.58 
 
 		 1142 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  32.43 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  34.03 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.71 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 538 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  32.26 
 
 		 1154 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  34.31 
 
 		 551 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  32.6 
 
 		 1154 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  33.6 
 
 		 564 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  33.21 
 
 		 562 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  33.13 
 
 		 1092 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  33.33 
 
 		 554 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  32.48 
 
 		 1152 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  34.06 
 
 		 583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  35.28 
 
 		 557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  32.77 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  32.12 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  32.5 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  35.42 
 
 		 525 aa  243  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.27 
 
 		 554 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  33.73 
 
 		 1088 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  32.55 
 
 		 1109 aa  243  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 553 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  32.56 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.2 
 
 		 538 aa  243  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  33.2 
 
 		 1088 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  32.87 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  33.47 
 
 		 1102 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  33 
 
 		 1102 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  32.51 
 
 		 1101 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  32.94 
 
 		 1088 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  33.71 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  33.47 
 
 		 1102 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>