More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3333 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  80.41 
 
 		 434 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 434 aa  865    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  71.4 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  70.94 
 
 		 433 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  70.94 
 
 		 433 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  54.81 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  55.03 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  55.53 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  52.74 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  58.21 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  53.98 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  51.72 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02180  glycosidase  45.66 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  35.41 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  30.36 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.27 
 
 		 587 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.23 
 
 		 586 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.23 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.52 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.02 
 
 		 588 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.1 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.3 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.42 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.3 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.3 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  25.94 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  29.49 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.1 
 
 		 586 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  26.73 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.29 
 
 		 481 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.59 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 481 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.41 
 
 		 610 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 663 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 		 575 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 574 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.51 
 
 		 583 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.68 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  29.18 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 622 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  28.34 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 635 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.85 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 486 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  27.31 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  31.49 
 
 		 578 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 		 496 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  28.26 
 
 		 586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  29.8 
 
 		 580 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  23.21 
 
 		 606 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  25.19 
 
 		 584 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 483 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 576 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 914 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 1401 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  29.81 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  26.64 
 
 		 1401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  28.19 
 
 		 480 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  23.35 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 1307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  24.3 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  28.25 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.13 
 
 		 610 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  24.69 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  25.64 
 
 		 522 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 		 1847 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  24.15 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.56 
 
 		 528 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.8 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.82 
 
 		 545 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  25.06 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  21.81 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  28.97 
 
 		 596 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.48 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  28.03 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.24 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  27.96 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  27.96 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>