More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1514 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 511 aa  1047    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  83.66 
 
 		 510 aa  897    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  41.19 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1270  alpha-amylase family protein  41.39 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000443122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1079  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000334423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1057  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000804906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1162  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1314  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000103321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1238  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1060  alpha-amylase family protein  40.99 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60641e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1211  alpha-amylase family protein  40.08 
 
 		 431 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.019383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4130  alpha-amylase family protein  39.88 
 
 		 431 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000772856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0875  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 		 440 aa  347  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  38.61 
 
 		 1021 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  33.26 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  31.67 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  32.8 
 
 		 490 aa  237  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  33.92 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  33.14 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  33.62 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  31.02 
 
 		 814 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  32.74 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  31.07 
 
 		 838 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.88 
 
 		 533 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 836 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 587 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  31.85 
 
 		 589 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.9 
 
 		 623 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32.53 
 
 		 481 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  30.64 
 
 		 642 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  33.19 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  33.18 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  32.79 
 
 		 584 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  31.53 
 
 		 649 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  33.73 
 
 		 589 aa  207  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  29.24 
 
 		 885 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  31.46 
 
 		 635 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  33.64 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  33.62 
 
 		 610 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 		 1017 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  32.03 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.54 
 
 		 1891 aa  203  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 1005 aa  200  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 493 aa  200  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 631 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.75 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  32.32 
 
 		 562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  33.6 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  30.44 
 
 		 762 aa  196  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  29.61 
 
 		 641 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  29.79 
 
 		 609 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.61 
 
 		 1855 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  31.67 
 
 		 665 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  29.09 
 
 		 654 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  31.13 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  30.09 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 		 630 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  31.74 
 
 		 1942 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  30.75 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  31.56 
 
 		 644 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  34.05 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  30.54 
 
 		 686 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  31.21 
 
 		 481 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 583 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.05 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  31.42 
 
 		 665 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.87 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.87 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  30.74 
 
 		 623 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.79 
 
 		 586 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  29.03 
 
 		 683 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  29.3 
 
 		 586 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  31.67 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  28.82 
 
 		 599 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  28.52 
 
 		 765 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  28.36 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  28.15 
 
 		 774 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.41 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  27.14 
 
 		 604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27.92 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.2 
 
 		 752 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  30.16 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  30.16 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  30.16 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  30.16 
 
 		 586 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  29.73 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.58 
 
 		 2638 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  30.7 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.93 
 
 		 586 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  33.02 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.57 
 
 		 2068 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  28.63 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 786 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  30.99 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>