More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4127 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  90.83 
 
 
541 aa  947    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
545 aa  1078    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  90.28 
 
 
541 aa  960    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  56.39 
 
 
588 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  51.09 
 
 
593 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  49.45 
 
 
595 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  47.97 
 
 
583 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  42.89 
 
 
499 aa  363  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  43.2 
 
 
515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  39.53 
 
 
654 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  42.95 
 
 
558 aa  329  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  35.91 
 
 
575 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.71 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 
522 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.92 
 
 
538 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  38.26 
 
 
509 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.14 
 
 
529 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.33 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 
553 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  40.36 
 
 
540 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  35.77 
 
 
532 aa  300  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  35.77 
 
 
1115 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  37.08 
 
 
545 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 
536 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  36.52 
 
 
548 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  39.72 
 
 
530 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.61 
 
 
539 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  36.7 
 
 
541 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  36.65 
 
 
1131 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  36.65 
 
 
1131 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  36.65 
 
 
1131 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  36.65 
 
 
1131 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  36.65 
 
 
1131 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  35.62 
 
 
1137 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  36.65 
 
 
1131 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  34.09 
 
 
535 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.69 
 
 
562 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.15 
 
 
525 aa  296  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  37.34 
 
 
540 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  36.19 
 
 
1137 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  36.19 
 
 
1137 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  36.19 
 
 
1137 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  35.49 
 
 
591 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  35.43 
 
 
1137 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 
549 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  35.48 
 
 
1101 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.66 
 
 
543 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  35.66 
 
 
1100 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  35.89 
 
 
682 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  35.1 
 
 
1136 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  35.78 
 
 
577 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 
535 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  32.63 
 
 
557 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
1138 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  36.25 
 
 
1088 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  36.25 
 
 
1088 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  36.94 
 
 
564 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  35.13 
 
 
1100 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  34.17 
 
 
563 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  35.74 
 
 
1100 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  35.25 
 
 
1102 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  36.44 
 
 
562 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  35.25 
 
 
1102 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  36.82 
 
 
541 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.27 
 
 
574 aa  290  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 
538 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  35.04 
 
 
1102 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  35.66 
 
 
1088 aa  289  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 
528 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.11 
 
 
572 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  35.53 
 
 
606 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  33.45 
 
 
1152 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  39.92 
 
 
542 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  38.22 
 
 
567 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  34.39 
 
 
1154 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  34.08 
 
 
1154 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  34.91 
 
 
551 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  35.94 
 
 
1088 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  35.98 
 
 
572 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  35.27 
 
 
1101 aa  286  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  34.1 
 
 
554 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  35.58 
 
 
1093 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  36.1 
 
 
1085 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  35.27 
 
 
1111 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  35.39 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  36.5 
 
 
1105 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  35.35 
 
 
1093 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  35.91 
 
 
601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  34.17 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  35.46 
 
 
1092 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  36.92 
 
 
575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  34.48 
 
 
1110 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  35.83 
 
 
1113 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  35.73 
 
 
1106 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  34.33 
 
 
585 aa  283  8.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  39.07 
 
 
558 aa  282  9e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  36.27 
 
 
556 aa  282  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  35.92 
 
 
1106 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  35.92 
 
 
1106 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  35.36 
 
 
1104 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>