More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2425 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 509 aa  1053    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  42.79 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  40.83 
 
 		 654 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  40.64 
 
 		 595 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  41.81 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  39.77 
 
 		 593 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  40.49 
 
 		 583 aa  319  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  38.26 
 
 		 545 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  36.38 
 
 		 541 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  37.75 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  36.71 
 
 		 588 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  35.67 
 
 		 575 aa  276  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  34.18 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  35.53 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  33.51 
 
 		 549 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  32.54 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  31.99 
 
 		 538 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  31.44 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.44 
 
 		 555 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  32.86 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  34.05 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  33.33 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  31.87 
 
 		 563 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  33.64 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  32.38 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  32.07 
 
 		 551 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  32.45 
 
 		 1116 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  32.26 
 
 		 1116 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  33.58 
 
 		 536 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.82 
 
 		 1114 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  30.58 
 
 		 558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  30.61 
 
 		 600 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 		 543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.94 
 
 		 561 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  30.04 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  31.35 
 
 		 558 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31.35 
 
 		 1142 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  29.68 
 
 		 554 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  30.57 
 
 		 554 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  31.48 
 
 		 582 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  31.06 
 
 		 535 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  30.27 
 
 		 561 aa  216  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  31.07 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.5 
 
 		 550 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.72 
 
 		 554 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 544 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  31.85 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  31.54 
 
 		 1110 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.5 
 
 		 550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  32.17 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 554 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  32.9 
 
 		 553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  32.87 
 
 		 540 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  30.54 
 
 		 558 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  31.55 
 
 		 558 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  33.71 
 
 		 647 aa  213  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  31.16 
 
 		 1088 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  29.17 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  31.16 
 
 		 1088 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  31.02 
 
 		 563 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  31.84 
 
 		 547 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.32 
 
 		 550 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  30.88 
 
 		 558 aa  213  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.29 
 
 		 538 aa  213  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  31.55 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  31.83 
 
 		 682 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  31.55 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  31.55 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  47.32 
 
 		 258 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  31.55 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  31.38 
 
 		 1111 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  31.37 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  31.05 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  30.75 
 
 		 815 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  30.02 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  29.48 
 
 		 604 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.14 
 
 		 550 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.2 
 
 		 555 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  30.29 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  30.29 
 
 		 546 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.2 
 
 		 555 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 554 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  30.83 
 
 		 1112 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.75 
 
 		 551 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  31.05 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.55 
 
 		 531 aa  210  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 545 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  31.5 
 
 		 1101 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.16 
 
 		 562 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  31.94 
 
 		 1119 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  30.78 
 
 		 1123 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  31.87 
 
 		 1088 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.88 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  29.6 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>