More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2593 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  60 
 
 
499 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  49.41 
 
 
515 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  49.15 
 
 
541 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  54.77 
 
 
541 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  53.27 
 
 
545 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  47.46 
 
 
654 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  47.39 
 
 
522 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  47.84 
 
 
493 aa  224  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  49.78 
 
 
595 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  46.27 
 
 
588 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  49.33 
 
 
593 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  47.32 
 
 
509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  48.09 
 
 
575 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  52.04 
 
 
555 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  52.04 
 
 
555 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  46.26 
 
 
583 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  52.58 
 
 
647 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  46.27 
 
 
1093 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  50 
 
 
552 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  48.26 
 
 
1136 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  46.27 
 
 
1093 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.09 
 
 
560 aa  194  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  47.45 
 
 
548 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  45.27 
 
 
1121 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  43.04 
 
 
1116 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  44.83 
 
 
455 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  42.61 
 
 
1116 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  43.27 
 
 
1088 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  47.26 
 
 
1138 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  47.26 
 
 
551 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  45.05 
 
 
815 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  45.92 
 
 
544 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  47.26 
 
 
1137 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  47.26 
 
 
1137 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  47.26 
 
 
1137 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  46.73 
 
 
555 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  47.26 
 
 
1137 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  46.04 
 
 
561 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  45.92 
 
 
563 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  42.79 
 
 
1088 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  47.26 
 
 
1137 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  45.64 
 
 
547 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  45.77 
 
 
1154 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 
548 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  47.4 
 
 
454 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  44.5 
 
 
1108 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  47.42 
 
 
543 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  42.64 
 
 
558 aa  188  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  42.45 
 
 
1092 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  42.72 
 
 
1102 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  43.78 
 
 
1102 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  46.97 
 
 
1130 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.32 
 
 
561 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  45.77 
 
 
1154 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  44.28 
 
 
1100 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  42.13 
 
 
682 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.83 
 
 
556 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  44.16 
 
 
606 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.39 
 
 
562 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  42.48 
 
 
551 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  45.54 
 
 
1139 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  43.78 
 
 
1102 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  44.39 
 
 
558 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  42.71 
 
 
548 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  39.49 
 
 
558 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.54 
 
 
560 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  42.31 
 
 
1088 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  42.31 
 
 
1088 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  44.78 
 
 
1152 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  45.41 
 
 
554 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  41.83 
 
 
1088 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  40.2 
 
 
530 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  46.34 
 
 
541 aa  185  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  43.44 
 
 
582 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  43.43 
 
 
1123 aa  184  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  44.33 
 
 
1131 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  44.28 
 
 
964 aa  184  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  42.45 
 
 
1105 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 
530 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
558 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  45.1 
 
 
1100 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  40.85 
 
 
572 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  44.9 
 
 
562 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  41.51 
 
 
1085 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  42.44 
 
 
548 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  46.04 
 
 
1119 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  45.03 
 
 
525 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>