More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3310 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  87.35 
 
 		 574 aa  1034    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 575 aa  1181    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  46.53 
 
 		 538 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  43.01 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  45.02 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  42.06 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  44.17 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  46.65 
 
 		 538 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  47.19 
 
 		 540 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  44.55 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  40.03 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  46.55 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  46.88 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  45.88 
 
 		 532 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  43.86 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  40.07 
 
 		 582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  38.66 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  38.57 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  46.15 
 
 		 530 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  45.44 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  46.72 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 		 536 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.31 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  45.05 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  36.81 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  36.98 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  36.63 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  36.63 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  36.63 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.63 
 
 		 554 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  36.63 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  45.13 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  38.88 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  38.34 
 
 		 554 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  36.6 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  39.15 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  36.46 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  43.79 
 
 		 542 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  36.77 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  42.05 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.67 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  36.74 
 
 		 554 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  36.46 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.35 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  36.72 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  36.94 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 537 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  39.9 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.8 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  36.13 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  38.19 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  36.77 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  36.6 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 540 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  38.87 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  36.21 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  36.21 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.5 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  36.77 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  38.18 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  38.18 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  36.13 
 
 		 554 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  40.68 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  38.18 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  36.77 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  37.26 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  37.83 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  37.11 
 
 		 549 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  36.9 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  36.78 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  37.11 
 
 		 549 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  39.42 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  35.86 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  39.33 
 
 		 539 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.79 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  35.81 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  38.46 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.4 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  37.48 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  40.21 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  37.59 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.11 
 
 		 586 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.98 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  38.29 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.71 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  39.47 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  39.2 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  41.21 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  38.51 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>