More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004234 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  58.9 
 
 		 551 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  58.44 
 
 		 551 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  58.9 
 
 		 551 aa  674    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  61.3 
 
 		 553 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.9 
 
 		 551 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.58 
 
 		 553 aa  697    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.76 
 
 		 553 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  60.76 
 
 		 553 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  60.22 
 
 		 553 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.55 
 
 		 563 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.61 
 
 		 554 aa  713    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.76 
 
 		 553 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 		 561 aa  1179    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.76 
 
 		 553 aa  678    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.72 
 
 		 550 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.76 
 
 		 553 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.72 
 
 		 551 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  95.01 
 
 		 561 aa  1134    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.94 
 
 		 553 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.43 
 
 		 556 aa  868    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.53 
 
 		 550 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.9 
 
 		 550 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.96 
 
 		 555 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  57.73 
 
 		 555 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  61.28 
 
 		 561 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.45 
 
 		 550 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.72 
 
 		 551 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.18 
 
 		 553 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.94 
 
 		 553 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.53 
 
 		 551 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  59.46 
 
 		 563 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.65 
 
 		 551 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  77.68 
 
 		 562 aa  945    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  71.81 
 
 		 560 aa  875    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.96 
 
 		 555 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  60.54 
 
 		 563 aa  710    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.27 
 
 		 550 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.5 
 
 		 551 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.89 
 
 		 551 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.71 
 
 		 546 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.71 
 
 		 546 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  51.96 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  49.55 
 
 		 558 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  50.63 
 
 		 562 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  49.19 
 
 		 558 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.44 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 		 558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 		 558 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  49.02 
 
 		 558 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  49.55 
 
 		 558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  49.55 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  50.73 
 
 		 538 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 562 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.02 
 
 		 556 aa  575  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  50.82 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  48.76 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  49.1 
 
 		 566 aa  567  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  48.85 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.8 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  47.7 
 
 		 570 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  49.36 
 
 		 541 aa  549  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  48.07 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  47.47 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.1 
 
 		 556 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.26 
 
 		 578 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  49.91 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.99 
 
 		 538 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  45.83 
 
 		 577 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.5 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  46.73 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  47.02 
 
 		 554 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  46.37 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  46.37 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  46.37 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  46.37 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.1 
 
 		 562 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  48.47 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  46.19 
 
 		 554 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.59 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  46.52 
 
 		 596 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  43.12 
 
 		 622 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  45.44 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  45.68 
 
 		 554 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  46.02 
 
 		 555 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  45.92 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  44.8 
 
 		 600 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  45.92 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  45.94 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.52 
 
 		 552 aa  502  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  44.46 
 
 		 571 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  44.01 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  44.91 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 590 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>