More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3755 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  98.73 
 
 
551 aa  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.87 
 
 
563 aa  818    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  98.73 
 
 
551 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  100 
 
 
551 aa  1155    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  57.66 
 
 
561 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  74.13 
 
 
553 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.51 
 
 
561 aa  828    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.48 
 
 
563 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.78 
 
 
554 aa  846    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  61.8 
 
 
562 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.65 
 
 
563 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.73 
 
 
551 aa  1140    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.91 
 
 
551 aa  1144    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.49 
 
 
550 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.49 
 
 
550 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.86 
 
 
555 aa  833    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.12 
 
 
550 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.44 
 
 
561 aa  673    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  56.88 
 
 
556 aa  661    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  83.94 
 
 
550 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.73 
 
 
551 aa  1142    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.91 
 
 
551 aa  1140    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  81.27 
 
 
551 aa  942    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.86 
 
 
555 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.53 
 
 
560 aa  666    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.73 
 
 
551 aa  1144    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  97.46 
 
 
551 aa  1131    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.31 
 
 
550 aa  987    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.91 
 
 
555 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.09 
 
 
553 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.27 
 
 
553 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.1 
 
 
553 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  54.36 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.01 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.36 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.01 
 
 
553 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.18 
 
 
553 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.18 
 
 
553 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  54 
 
 
553 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.46 
 
 
546 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.46 
 
 
546 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.19 
 
 
556 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  51.27 
 
 
553 aa  571  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  52.24 
 
 
565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.36 
 
 
553 aa  557  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  46.22 
 
 
559 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  45.09 
 
 
558 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  45.45 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  45.27 
 
 
558 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 
558 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  46.98 
 
 
557 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  44.91 
 
 
558 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  45.09 
 
 
558 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  44.91 
 
 
558 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  47.76 
 
 
560 aa  531  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  44.91 
 
 
558 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  44.73 
 
 
558 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  45.09 
 
 
558 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  46.18 
 
 
562 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  47.49 
 
 
556 aa  530  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.4 
 
 
556 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  47.73 
 
 
557 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  44.77 
 
 
562 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.59 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  46.3 
 
 
541 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.13 
 
 
560 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  45.99 
 
 
577 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.57 
 
 
538 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.51 
 
 
578 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  43.04 
 
 
538 aa  498  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.14 
 
 
556 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.13 
 
 
531 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.52 
 
 
552 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  44.72 
 
 
570 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  43.24 
 
 
563 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  42.93 
 
 
566 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  45.84 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  42.15 
 
 
590 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  46.29 
 
 
535 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  47.47 
 
 
596 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  43.35 
 
 
555 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  42.18 
 
 
582 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  46.43 
 
 
622 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  45.69 
 
 
536 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.03 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  44.84 
 
 
606 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  42.06 
 
 
552 aa  458  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  42.19 
 
 
568 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  45.63 
 
 
639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.73 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  40.87 
 
 
554 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  45.11 
 
 
571 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  43.42 
 
 
555 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  39.96 
 
 
554 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  40.4 
 
 
554 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  40.4 
 
 
554 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  39.93 
 
 
554 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  40.29 
 
 
554 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  41.2 
 
 
600 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>