More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  63.14 
 
 		 578 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  63.92 
 
 		 571 aa  685    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  57.99 
 
 		 622 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  61.15 
 
 		 577 aa  691    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  100 
 
 		 596 aa  1205    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  59.44 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 562 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  50.43 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  50.61 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  50.09 
 
 		 558 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 558 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  49.05 
 
 		 559 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  50.09 
 
 		 558 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  50.77 
 
 		 562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  55.29 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  51.3 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  50.25 
 
 		 606 aa  561  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 570 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.8 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  51.65 
 
 		 639 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.13 
 
 		 563 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.28 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.14 
 
 		 560 aa  529  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  45.94 
 
 		 566 aa  531  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.52 
 
 		 561 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  46.21 
 
 		 538 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  45.5 
 
 		 554 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.72 
 
 		 538 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  45.53 
 
 		 554 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  50.26 
 
 		 590 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 563 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  45.08 
 
 		 554 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  45.19 
 
 		 554 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  45.53 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  45.53 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  45.53 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  44.71 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  45.53 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.34 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  44.81 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  47.3 
 
 		 561 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  45.28 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  46.77 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.69 
 
 		 562 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.76 
 
 		 553 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.23 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.98 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  46.03 
 
 		 555 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  44.67 
 
 		 568 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.5 
 
 		 553 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.17 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.87 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.87 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.04 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.21 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  46.55 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  43.33 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.35 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.18 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  43.18 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.18 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  41.87 
 
 		 554 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.29 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.19 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  47.65 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  47.65 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.34 
 
 		 546 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.65 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.34 
 
 		 546 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  41.35 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.51 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  44.19 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.25 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.84 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.49 
 
 		 562 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.46 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  44.19 
 
 		 549 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.47 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  45.38 
 
 		 582 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.47 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.17 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 		 536 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  44.77 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.45 
 
 		 551 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.36 
 
 		 551 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  46.53 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  44.43 
 
 		 600 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.18 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  45.15 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.18 
 
 		 555 aa  475  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.18 
 
 		 555 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.52 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.94 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>