More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4886 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  67.6 
 
 		 578 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 571 aa  1162    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  64.03 
 
 		 596 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  62.1 
 
 		 622 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  69.23 
 
 		 577 aa  772    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  64.78 
 
 		 555 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  60.35 
 
 		 557 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  53.94 
 
 		 562 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  51.05 
 
 		 557 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  51.57 
 
 		 562 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  52.56 
 
 		 606 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  52.43 
 
 		 570 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  49.22 
 
 		 558 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  49.22 
 
 		 558 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 		 558 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  49.05 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  48.87 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  48.95 
 
 		 559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.56 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  49.13 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  48.7 
 
 		 558 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  54.36 
 
 		 639 aa  561  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  49.12 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.82 
 
 		 563 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  48.5 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  46.9 
 
 		 538 aa  534  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  46.47 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.02 
 
 		 563 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  45.82 
 
 		 563 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.55 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.28 
 
 		 556 aa  518  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  49.74 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  44.25 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.99 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.42 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  45.7 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  46.92 
 
 		 582 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  47.99 
 
 		 600 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  44.33 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  44.33 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  43.49 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  45.55 
 
 		 556 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.27 
 
 		 538 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.31 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  44.82 
 
 		 551 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  42.78 
 
 		 554 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.78 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 		 554 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.36 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  42.96 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  42.96 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  43.13 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  43.13 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  43.13 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  43.13 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.22 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  42.61 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.66 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  44.88 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.14 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.14 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.38 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.38 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.33 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.21 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.03 
 
 		 553 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.03 
 
 		 553 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.61 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.09 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.03 
 
 		 553 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.83 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  44.56 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  44.56 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.81 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.85 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.86 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.86 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.86 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.15 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.15 
 
 		 550 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.33 
 
 		 550 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.31 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.82 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  46.49 
 
 		 572 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.68 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  45.99 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.97 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.45 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.45 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.56 
 
 		 551 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.03 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.45 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.39 
 
 		 561 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.49 
 
 		 551 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>