More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1851 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  64.79 
 
 
535 aa  730    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  61.23 
 
 
538 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 
531 aa  1101    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  59.85 
 
 
538 aa  662    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  64.18 
 
 
536 aa  711    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  56.91 
 
 
566 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  57.36 
 
 
559 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  55.97 
 
 
558 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  55.61 
 
 
558 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  54.63 
 
 
562 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  55.97 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  56.13 
 
 
558 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  56.13 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  56.48 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  56.13 
 
 
558 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  55.95 
 
 
558 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  56.13 
 
 
558 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  55.77 
 
 
558 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  55.6 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  51.77 
 
 
562 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.1 
 
 
563 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  52.41 
 
 
578 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.77 
 
 
556 aa  529  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.19 
 
 
563 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.36 
 
 
553 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  48.36 
 
 
553 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.36 
 
 
553 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.36 
 
 
553 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 
570 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  48.36 
 
 
553 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.41 
 
 
546 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.62 
 
 
553 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  50.49 
 
 
563 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.41 
 
 
546 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  47.93 
 
 
554 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  47.02 
 
 
577 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  49 
 
 
582 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  48.48 
 
 
590 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  47.49 
 
 
551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.69 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.45 
 
 
553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.62 
 
 
553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.99 
 
 
553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  50.57 
 
 
560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.49 
 
 
562 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  46.45 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  47.57 
 
 
554 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  49.32 
 
 
554 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.45 
 
 
553 aa  515  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  47.57 
 
 
554 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  47.57 
 
 
554 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  47.03 
 
 
554 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.45 
 
 
560 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  47.39 
 
 
554 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  47.39 
 
 
554 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.59 
 
 
561 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  47.39 
 
 
554 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  47.03 
 
 
554 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  47.39 
 
 
554 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  50.99 
 
 
622 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  46.4 
 
 
555 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  50 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.9 
 
 
562 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.96 
 
 
554 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  46.65 
 
 
554 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  46.31 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.49 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.62 
 
 
554 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  46.47 
 
 
554 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  46.31 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.13 
 
 
551 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  49.34 
 
 
596 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  47.07 
 
 
555 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.94 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.13 
 
 
551 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  48.66 
 
 
556 aa  495  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.75 
 
 
560 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.76 
 
 
550 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.76 
 
 
551 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.02 
 
 
550 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.02 
 
 
550 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 
556 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.76 
 
 
551 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  48.79 
 
 
606 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.57 
 
 
551 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.02 
 
 
550 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.22 
 
 
561 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  45.49 
 
 
549 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.97 
 
 
555 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.39 
 
 
560 aa  485  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  45.49 
 
 
549 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.15 
 
 
553 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.97 
 
 
555 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.02 
 
 
550 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  43.39 
 
 
534 aa  483  1e-135  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.47 
 
 
556 aa  482  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.3 
 
 
563 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  42.16 
 
 
639 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  46.44 
 
 
568 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>